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2023 Fiscal Year Research-status Report

標的タンパク質結合ペプチド一斉同定を可能にする新規超高速スクリーニング技術の開発

Research Project

Project/Area Number 21K06475
Research InstitutionUniversity of Yamanashi

Principal Investigator

川上 隆史  山梨大学, 大学院総合研究部, 助教 (60638881)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
KeywordsDirected evolution / SELEX / PUREシステム / 遺伝暗号拡張技術 / in vitro virus / mRNAディスプレイ / cDNAディスプレイ / FGFR
Outline of Annual Research Achievements

PURE(Polypeptide synthesis Using Recombinant Elements)システムと遺伝暗号拡張技術(genetic code expansion)とin vitro virus(mRNAディスプレイ)法あるいはcDNAディスプレイ法を用いて、芳香族求核置換反応(Yokoyama et al.、Chemical Communications、58、5237-5240、2022)などにより環状化した非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物のDNAコード化ライブラリー(DEL)より、分子進化工学的スクリーニング(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, SELEX)法を用いて、がんに関わる創薬標的タンパク質である線維芽細胞増殖因子受容体(FGFR)などに結合する完全新規の非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物を複数種類、同定することに成功した。また、同定した新規FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物が、FGF/FGFR間相互作用を阻害すること、FGFR発現細胞MCF7内のFGF依存的なERKリン酸化活性をアンタゴナイズすること、MCF7のFGF依存的な細胞増殖を阻害することも発見した。更に、FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物二量体が、FGF依存的に増殖するヒトiPS細胞の未分化維持増殖を促すアゴニスト活性を有することも発見した。 本研究成果は、日本薬学会第144年会、および、第75回日本細胞生物学会で成果発表を行なっている。また、査読付き学術論文であるBioscience, Biotechnology, and Biochemistry誌に掲載される研究成果発表も併せて行なっている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

数兆種類の非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物のDNAコード化ライブラリー(DEL)より、分子進化工学的スクリーニング(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, SELEX)法を用いて、がんに関わる創薬標的タンパク質である線維芽細胞増殖因子受容体(FGFR)などに結合する完全新規の非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物を複数種類、同定することに成功したため。また、同定した新規FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物が、FGF/FGFR間相互作用を阻害すること、FGFR発現細胞MCF7内のFGF依存的なFGFRリン酸化活性をアンタゴナイズすること、MCF7のFGF依存的な細胞増殖を阻害することも発見したため。 更に、FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物二量体が、FGF依存的に増殖するヒトiPS細胞の未分化維持増殖を促すアゴニスト活性を有することも発見したため。そして、本研究成果は、日本薬学会第144年会、および、第75回日本細胞生物学会で成果発表を行なっているため。また、査読付き学術論文であるBioscience, Biotechnology, and Biochemistry誌に掲載される研究成果発表も併せて行なっているため。

Strategy for Future Research Activity

これまでに、PURE(Polypeptide synthesis Using Recombinant Elements)システムと遺伝暗号拡張技術(genetic code expansion)とin vitro virus(mRNAディスプレイ)法あるいはcDNAディスプレイ法を用いて、芳香族求核置換反応などにより環状化した非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物のDNAコード化ライブラリー(DEL)より、分子進化工学的スクリーニング(Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment, SELEX)法を用いて、がんに関わる創薬標的タンパク質である線維芽細胞増殖因子受容体(FGFR)などに結合する完全新規の非天然型環状(Nアルキル)ペプチド化合物を複数種類、同定することに成功した。また、同定した新規FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物が、FGF/FGFR間相互作用を阻害すること、FGFR発現細胞MCF7内のFGF依存的なFGFRリン酸化活性をアンタゴナイズすること、MCF7のFGF依存的な細胞増殖を阻害することも発見した。更に、FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物二量体が、FGF依存的に増殖するヒトiPS細胞の未分化維持増殖を促すアゴニスト活性を有することも発見した。
そこで今後は、SELEXスクリーニングにより同定した新規FGFR結合環状(Nアルキル)ペプチド化合物をモデル標的タンパク質結合ペプチドとして、標的タンパク質結合ペプチド一斉同定を可能にする新規超高速スクリーニング技術を開発していく予定である。

Causes of Carryover

研究計画が順調に進んだため、計画よりも研究費を抑えることが可能となった。また、所属機関の共用機器が使用可能となったため、計画よりも研究費を抑えることが可能となった。引き続き、生物学実験試薬・器具、化学実験試薬・器具などの物品費、配列解析のためのその他費用として使用する計画である。

  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] SELEX-discovered aptamer that inhibits cellular interleukin-17/interleukin-17 receptor interaction and antagonizes interleukin-17 signaling2023

    • Author(s)
      Munshi Arifur Rahman、Wang Tong、Takamori Yukio、Ando Takehiro、Yokoyama Takumi、Fuji Daisuke、Xu Zhehao、Vedi Santhana、Yamamoto Mizuki、Tsukamoto Keita、Kawakami Takashi
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 88 Pages: 147~153

    • DOI

      10.1093/bbb/zbad170

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] SELEX法による新規小分子結合ペプチドタグの同定と生細胞内タンパク質の蛍光イメージング、オプトジェネティクスとノックダウンへの応用2024

    • Author(s)
      山本美月、安東丈洋、高守幸男、横山匠、冨士大輔、Munshi Arifur Rahman、Vedi Santhana、Wang Tong、川上隆史
    • Organizer
      日本薬学会第144年会
  • [Presentation] Discovery and functional analysis of novel unnatural cyclic peptides by SELEX for hypercholesterolemia treatment2024

    • Author(s)
      Vedi Santhana、安東丈洋、横山匠、高守幸男、冨士大輔、Munshi Arifur Rahman、Wang Tong、山本美月、川上隆史
    • Organizer
      日本薬学会第144年会
  • [Presentation] Functional analysis of bioactive unnatural cyclic peptides discovered by SELEX using the PURE system, genetic code expansion and mRNA display2024

    • Author(s)
      Munshi Arifur Rahman、横山匠、安東丈洋、高守幸男、冨士大輔、Vedi Santhana、Wang Tong、山本美月、川上隆史
    • Organizer
      日本薬学会第144年会
  • [Presentation] Discovery of novel unnatural cyclic peptides by SELEX2023

    • Author(s)
      Tong Wang, Takehiro Ando, Takumi Yokoyama, Yukio Takamori, Daisuke Fuji, Santhana Vedi, Arifur Rahman Munshi, Mizuki Yamamoto and Takashi Kawakami
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会
  • [Presentation] Discovery of novel IL-17/IL-17RA interaction inhibitors by SELEX2023

    • Author(s)
      Arifur Rahman Munshi, Takehiro Ando, Takumi Yokoyama, Yukio Takamori, Daisuke Fuji, Santhana Vedi, Tong Wang, Mizuki Yamamoto and Takashi Kawakami
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会
  • [Remarks] 川上研のHP

    • URL

      https://tkawakami.wixsite.com/kawakami-laboratory

URL: 

Published: 2024-12-25  

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