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2023 Fiscal Year Annual Research Report

B型肝炎ウイルスの肝細胞侵入・増殖機構の構造基盤と立体構造に基づく創薬

Research Project

Project/Area Number 21K06494
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

横川 真梨子  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 講師 (60648020)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大澤 匡範  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 教授 (60361606)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsB型肝炎ウイルス / タンパク質―タンパク質相互作用 / NMR / 等温滴定型カロリメトリー
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、B型肝炎ウイルス(HBV)が肝細胞に侵入する際に必須のpreS1とNTCPの相互作用、およびHBVの増殖時に必要なpreSとキャプシド(Cp)の相互作用を原子分解能で明らかにすることでHBVの肝細胞侵入・増殖のメカニズムを解明すること、さらに明らかにした相互作用様式に基づき、その相互作用を阻害する化合物を抗HBV薬候補化合物として提唱することを目的としている。
2023年度は、preS1に結合してNTCPとの相互作用を阻害することが報告されているカテキン二量体であるoolonghomobisflavan C (OHBF-C) とpreS1との相互作用を原子レベルで明らかにすることを目指した。NMR解析によりOHBF-Cと直接結合することが分かったpreS1を5分割した部分ペプチドのそれぞれについて、等温滴定型カロリメトリー (ITC) によるOHBF-Cとの相互作用の定量的な解析を試みた。しかし、0.1 mMのpreS1の部分ペプチドに対して1 mMのOHBF-Cを添加する実験条件では、結合にともなう有意な熱量変化がほとんど観測されなかったため、解離定数を算出することはできなかった。ITCとNMR実験の結果より、preS1部分ペプチドとOHBF-Cの解離定数は1 mM以上と考えたが、preS1ではOHBF-Cとの複数の結合領域がペプチド結合で連結され近傍に存在することにより、結合親和性が増大していると考える。さらに、OHBF-CにもpreS1結合部位が2個あるため、preS1とOHBF-Cは多価の相互作用により結合親和性が増大し、複合体が沈殿することが示唆された。

  • Research Products

    (16 results)

All 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (14 results)

  • [Journal Article] Applying deep learning to iterative screening of medium-sized molecules for protein-protein interaction-targeted drug discovery2023

    • Author(s)
      Shimizu Yugo、Yonezawa Tomoki、Bao Yu、Sakamoto Junichi、Yokogawa Mariko、Furuya Toshio、Osawa Masanori、Ikeda Kazuyoshi
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 59 Pages: 6722~6725

    • DOI

      10.1039/d3cc01283b

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] TDP‐43 N‐terminal domain dimerisation or spatial separation by RNA binding decreases its propensity to aggregate2023

    • Author(s)
      Miura Motoki、Sakaue Fumika、Matsuno Hirokazu、Morita Kento、Yoshida Akiko、Hara Rintaro Iwata、Nishimura Ren、Nishida Yurika、Yokogawa Mariko、Osawa Masanori、Yokota Takanori
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 597 Pages: 1667~1676

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14635

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural insights into the inhibitory mechanism of transcription factor FOXO3a by phosphorylation and 14-3-3ζ2023

    • Author(s)
      榎本翔太,桑山知也,中塚将一,横川真梨子,河津光作,中村吏佐,木村友美,田辺幹雄,千田俊哉,齋藤潤,佐谷秀行,大澤匡範
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Structural mechanism for the acceleration of the Caf1-dependent deadenylation of mRNA by BTG22023

    • Author(s)
      片岡奈緒,横川真梨子,石井裕一郎,城えりか,高嶋大翔,沢崎綾一,寒河江彪流,尾上耕一,星野真一,大澤匡範
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] タンパク質-タンパク質相互作用をターゲットとした感染阻害大環状物質の探索と構造活性相関解析2023

    • Author(s)
      米澤朋起,清水祐吾,池田和由,山本雄一朗,野口耕司,酒井祥太,深澤征義,横川真梨子,大澤匡範
    • Organizer
      第51回構造活性相関シンポジウム
  • [Presentation] NMR解析により得られたKeap1-Nrf2のPPI阻害化合物のKeap1結合の構造基盤2023

    • Author(s)
      小島行人,石田英子,原田彩佳,米澤朋起,清水祐吾,池田和由,横川真梨子,大澤匡範
    • Organizer
      第62回NMR討論会
  • [Presentation] hACE2に結合してSARS-CoV-2の侵入を阻害する化合物の創製2023

    • Author(s)
      横川真梨子, 堀内まほろ, 金一駿希, 大竹帝河, 米澤朋起, 清水祐吾, 池田和由, 山本雄一朗, 酒井祥太, 野口耕司, 深澤征義, 大澤匡範
    • Organizer
      第62回NMR討論会
  • [Presentation] SARS-CoV-2スパイクタンパク質に結合してSARS-CoV-2の侵入を阻害する化合物の創製2023

    • Author(s)
      金一駿希, 横川真梨子, 堀内まほろ,大竹帝河, 米澤朋起, 清水祐吾, 池田和由, 山本雄一朗, 酒井祥太, 野口耕司, 深澤征義, 大澤匡範
    • Organizer
      第62回NMR討論会
  • [Presentation] 14-3-3ζによる転写因子FOXO3aの阻害メカニズムの解明2023

    • Author(s)
      榎本翔太,桑山知也,中塚将一,横川真梨子,河津光作,中村吏佐,木村友美,田辺幹雄,千田俊哉,齋藤潤,佐谷秀行,大澤匡範
    • Organizer
      第62回NMR討論会
  • [Presentation] Discovery of the middle-sized compounds inhibiting the SARS-CoV-2 viral entry, using in silico approach and NMR analysis2023

    • Author(s)
      横川真梨子, 堀内まほろ, 金一駿希, 大竹帝河, 米澤朋起, 清水祐吾, 池田和由, 山本雄一朗, 酒井祥太, 野口耕司, 深澤征義, 大澤匡範
    • Organizer
      CBI学会2023年大会
  • [Presentation] Structural basis of the inhibition of the Keap1-Nrf2 interaction by novel PPI inhibitors discovered by machine learning2023

    • Author(s)
      Koujin Kojima,Hanako Ishida,Ayaka Harada,Tomoki Yonezawa,Yugo Shimizu,Kazuyoshi Ikeda,Mariko Yokogawa,Masanori Osawa
    • Organizer
      CBI学会2023年大会
  • [Presentation] ALSの原因となるTDP-43の沈殿形成を抑制するRNAの探索2023

    • Author(s)
      西田優理華,西村錬,横川真梨子,坂上史佳,横田隆徳,大澤匡範
    • Organizer
      第67回日本薬学会関東支部大会
  • [Presentation] HBV PreS1/NTCP相互作用に対する阻害剤簡易スクリーニング系の構築2023

    • Author(s)
      堀渕慶太,入間田早瑛,山本雄一朗,横川真梨子, 清水祐吾,米澤朋起,池田和由,浅見仁太,清水敏之,大戸梅治,深澤征義,大澤匡範,野口耕司
    • Organizer
      第67回日本薬学会関東支部大会
  • [Presentation] ALSの原因となるTDP-43沈殿を抑制するRNAの創製2023

    • Author(s)
      西村錬,西田優理華,横川真梨子,坂上史佳,横田隆徳,大澤匡範
    • Organizer
      PPF2023 第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
  • [Presentation] リン酸化および14-3-3ζの結合による転写因子FOXO3aの機能抑制機構の解明2023

    • Author(s)
      榎本翔太,桑山知也,横川真梨子,中塚将一,河津光作,中村吏佐,木村友美,齋藤潤,佐谷秀行,大澤匡範
    • Organizer
      PPF2023 第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
  • [Presentation] NMRを活用したSARS-CoV-2スパイクタンパク質とhACE2の相互作用を標的とするSARS-CoV-2侵入阻害化合物の分子設計2023

    • Author(s)
      横川真梨子, 堀内まほろ, 金一駿希, 大竹帝河, 米澤朋起, 清水祐吾, 池田和由, 山本雄一朗, 酒井祥太, 野口耕司, 深澤征義, 大澤匡範
    • Organizer
      第23回日本蛋白質科学会年会

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Published: 2024-12-25  

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