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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of the molecular basis of Gata2 gene activation in mast cells

Research Project

Project/Area Number 21K06816
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

大根田 絹子  東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 教授 (50323291)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大森 慎也  高崎健康福祉大学, 薬学部, 講師 (10509194)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsマスト細胞 / エンハンサー / 転写因子 / 遺伝子発現制御 / トランスクリプトーム / 好塩基球
Outline of Annual Research Achievements

GATA2は、造血幹細胞・前駆細胞をはじめ、赤芽球、巨核球、好酸球、好塩基球、マスト細胞に発現しており、正常な血球分化において重要な役割を担っている。ヒトとマウスのマスト細胞においてGATA2遺伝子は高いレベルで発現しており、Kit, Tpsb2, Cpa3などの標的遺伝子の発現量も高いレベルで維持されている。これらの遺伝子産物はマスト細胞自身の生存・増殖やマスト細胞特異的な機能発現に重要である。本研究では、マウスGata2遺伝子の転写開始点から+53-57kbpに存在するGATA2 downstream mast cell and basophil enhancer (G2DMBE)と命名した領域が、マスト細胞において強く活性化しているという知見に基づき、その機能を解析することで、マスト細胞におけるGata2遺伝子高度活性化の分子機序を明らかにすることを目的としている。
令和5年度は、前年度に続いてGata2 DRE欠失マウス(delG2DREマウス)の解析を行った。delG2DREマウスでは、耳介皮下マスト細胞の数は野生型と同等であったが、腹腔マスト細胞の割合がやや低下していた。骨髄マスト細胞(Bone marrow mast cells: BMMCs)の形成は野生型マウスの3分の1以下に低下し、RNA-seqによるトランスクリプトーム解析ではGATA2の標的遺伝子の一部の発現が低下していたが、発現量が維持されている遺伝子もあった。前年度、delG2DREマウスの骨髄では好塩基球の形成が障害されていることを見出したため、分化障害がみられる段階を解析した。その結果、マスト細胞と共通の前駆細胞(BMP)の段階から既に分化が障害されており、特にPreBMPという段階でIL-3に応答した細胞増殖が著しく低下していることが明らかになった。

  • Research Products

    (23 results)

All 2024 2023

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Whole blood transcriptome analysis for age- and gender-specific gene expression profiling in Japanese individuals2024

    • Author(s)
      Aoki Yu-ichi、Taguchi Keiko、Anzawa Hayato、Kawashima Junko、Ishida Noriko、Otsuki Akihito、Hasegawa Atsushi、Baird Liam、Suzuki Takafumi、Motoike Ikuko N、Ohneda Kinuko、Kumada Kazuki、Katsuoka Fumiki、Kinoshita Kengo、Yamamoto Masayuki
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/jb/mvae008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] バイオバンクの産学連携による利活用促進2024

    • Author(s)
      大根田 絹子, 野口 憲一
    • Journal Title

      遺伝子医学

      Volume: 14 Pages: 53-59

  • [Journal Article] 一般住民に対する遺伝性腫瘍の生殖細胞系列変異の情報開示2024

    • Author(s)
      大根田 絹子
    • Journal Title

      癌と化学療法

      Volume: 51 Pages: 231-236

  • [Journal Article] Effect of Nicotinamide Mononucleotide Concentration in Human Milk on Neurodevelopmental Outcome: The Tohoku Medical Megabank Project Birth and Three-Generation Cohort Study2023

    • Author(s)
      Saito Yoshie、Sato Keigo、Jinno Shinji、Nakamura Yoshitaka、Nobukuni Takahiro、Ogishima Soichi、Mizuno Satoshi、Koshiba Seizo、Kuriyama Shinichi、Ohneda Kinuko、Morifuji Masashi
    • Journal Title

      Nutrients

      Volume: 16 Pages: 145~145

    • DOI

      10.3390/nu16010145

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 前向きゲノムコホート参加者を対象とした遺伝性乳がん卵巣がんの遺伝情報回付2023

    • Author(s)
      大根田 絹子
    • Journal Title

      産業保健法学会誌

      Volume: 2 Pages: 121~125

    • DOI

      10.57523/jaohl.2.1_121

  • [Journal Article] Detection of Chip Variants Based on a Large Japanese WGS Data2023

    • Author(s)
      Chi Sunggi、Motoike Ikuko、Tsuchihara Katsuya、Ohneda Kinuko、Minami Yosuke、Yamashita Riu
    • Journal Title

      Blood

      Volume: 142 Pages: 5596~5596

    • DOI

      10.1182/blood-2023-185202

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 転写因子GATA2は炎症性サイトカイン遺伝子座のクロマチン構造を変換し発 現活性化に寄与する2023

    • Author(s)
      植木陽向, 高井淳,大森慎也, 大根田絹子, 上村聡志, 森口尚
    • Organizer
      第89回日本生化学会東北支部例会
  • [Presentation] マスト細胞・好塩基球の分化にはたらくGata2 3’-distal enhancerの解析2023

    • Author(s)
      大森慎也, 鈴木未来子, 高井淳, 森口尚, 森哲哉, 大根田絹子
    • Organizer
      2023年度日本生化学会関東支部例会
  • [Presentation] 未発症のBRCA1/2病的バリアント保持者に対するサーベイランスの課題2023

    • Author(s)
      濱中洋平, 多田寛, 原田成美, 宮下穣, 江幡明子, 佐藤未来, 柳垣美歌, 本成登貴和, 川目裕, 鈴木洋一, 長神風二, 布施昇男, 大根田絹子, 山本雅之, 石田孝宣
    • Organizer
      第33回日本乳癌検診学会学術総会
  • [Presentation] ゲノムコホート研究参加者5万人を対象としたBRCA1/2遺伝情報の回付と医療への連携2023

    • Author(s)
      濱中 洋平, 大根田 絹子, 川目 裕, 布施 昇男, 長神 風二, 鈴木 洋一, 山口 由美, 多田 寛, 原田 成美, 宮下 穣, 江幡 明子, 佐藤 未来, 柳垣 美歌, 本成 登貴和, 山本 雅之, 石田 孝宣
    • Organizer
      第31回日本乳癌学会学術総会
  • [Presentation] バイオバンク・ネットワーク ブース出展におけるバイオバンクの利活用促進について2023

    • Author(s)
      長神風二, 井上真季子, 笠原直子, 永家聖, 信國宇洋, 大根田絹子, 荻島創一
    • Organizer
      第8回クリニカルバイオバンク学会シンポジウム
  • [Presentation] 東北メディカル・メガバンク計画バイオバンク リソースを利用した論文と分譲実績の分析に 基づいた利活用の傾向2023

    • Author(s)
      松原博子, 山口由美, 舘野穣, 信國宇洋, 大根田絹子
    • Organizer
      第8回クリニカルバイオバンク学会シンポジウム
  • [Presentation] Detection of CHIP variants based on a large number of Japanese WGS data2023

    • Author(s)
      SungGi Chi, Riu Yamashita, Katsuya Tsuchihara, Kinuko Ohneda
    • Organizer
      2023年日本バイオインフォマティクス学会年会・第12回生命医薬情報学連合大会
  • [Presentation] Returning individual genomic results to population-based cohort study participants with pathogenic variants in hereditary cancer syndrome2023

    • Author(s)
      Kinuko Ohneda, Yoichi Suzuki, Yohei Hamanaka, Hiroshi Kawame, Nobuo Fuse, Fuji Nagami, Tomoko Kobayashi, Masanobu Takahashi, Muneaki Shimada, Masayuki Yamamoto
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第68回大会. Human Genetics Asia 2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Clinical features of BRCA1 and BRCA2 pathogenic variant carriers in the population-based cohort study in Japan2023

    • Author(s)
      Yoichi Suzuki, Kinuko Ohneda, Yohei Hamanaka, Nobuo Fuse, Fuji Nagami, Hiroshi Kawame, Masayuki Yamamoto
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第68回大会. Human Genetics Asia 2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] An innovative attempt to assist REC procedure for the medical research involving samples and information held by national network2023

    • Author(s)
      Hiroko TERUI-KOHBATA, Fuji NAGAMI, Kinuko OHNEDA, Takayuki MORISAKI, Yuichi GOTO, Eisei NOIRI,Hiroyuki NISHIYAMA, Manabu MUTO, Mizuki MIRITA, Soichi OGISHIMA, Masayuki YOSHIDA
    • Organizer
      CBI学会2023年大会
  • [Presentation] 転写因子GATA2は炎症関連遺伝子座の クロマチン構造を変換し発現活性化に寄与する2023

    • Author(s)
      高井淳, 植木陽向, 大森慎也, 大根田絹子, 上村聡志, 森口尚
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
  • [Presentation] マスト細胞・好塩基球分化過程ではたらく新規Gata2遠位エンハンサーの解析2023

    • Author(s)
      大森慎也, 鈴木未来子, 高井淳, 森口尚, 森哲哉, 大根田絹子
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] リンチ症候群遺伝子バリアントの健常者コホートへの情報回付の取り組み2023

    • Author(s)
      高橋雅信, 大根田絹子, 濱中洋平, 川村真亜子, 青木洋子, 島田宗昭, 谷口桜, 大内康太, 小峰啓吾, 今井源, 西條憲, 山本雅之, 石岡千加史
    • Organizer
      第27 回東北家族性腫瘍研究会学術集会
  • [Presentation] ゲノムコホート研究参加者に対するLynch症候群病的バリアント保有者へのゲノム情報回付2023

    • Author(s)
      大根田絹子
    • Organizer
      第5回がんゲノム医療時代におけるLynch症候群研究会
  • [Presentation] 東北メディカル・メガバンク計画におけるバイオバンク事業について2023

    • Author(s)
      大根田絹子
    • Organizer
      日本医療検査科学会第37回春季セミナー
    • Invited
  • [Presentation] ゲノムコホート調査参加者への 薬理遺伝学検査の情報回付2023

    • Author(s)
      大根田絹子
    • Organizer
      第6回薬理ゲノミクスセミナー
    • Invited
  • [Presentation] 東北メディカル・メガバンク計画 における一般住民への遺伝情報回付2023

    • Author(s)
      大根田絹子
    • Organizer
      第73回日本体質医学会総会
    • Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

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