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2022 Fiscal Year Research-status Report

3次元病理診断を可能とする新規染色技術の開発

Research Project

Project/Area Number 21K06903
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

野島 聡  大阪大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (40528791)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords3次元イメージング / 組織透明化 / 新規診断技術 / 炎症性腸疾患
Outline of Annual Research Achievements

新たに開発した蛍光染色法/3次元イメージング法(PAFhy staining / PAFhy-3D)により取得した3次元的データより光学スライスを出力し、これを機械学習 (EfficentNet-B4) による自動診断系に応用した。開発された診断系は、潰瘍性大腸炎、クローン病、非炎症性腸疾患の鑑別を、AUC=0.94 の高精度にて診断することができた。また、適切な閾値の設定により診断成績を算出したところ、87.59%(潰瘍性大腸炎)、85.79%(クローン病)、90.86%(非炎症性腸疾患)の正確度で診断を行うことができた。さらに、勾配加重クラス活性化マッピング (Grad-CAM) の手法を用いてこれらの診断がどういった所見を重視して行われているか解析を行ったところ、潰瘍性大腸炎およびクローン病では60%程度、非炎症性腸疾患では90%程度が、陰窩あるいは陰窩と周囲間質との境界部に着目して機械学習系による診断が行われていることが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究成果について学術論文として発表することができた。

Strategy for Future Research Activity

当新規蛍光染色法/3次元イメージング法をより幅広い疾患に応用する。また、化合物のスクリーニングにより、新たな別の染色法/3次元イメージング法の開発を目指す。

Causes of Carryover

該当予算を使用する実験計画が、次年度以降に予定されることとなったため。

  • Research Products

    (6 results)

All 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Ovarian high‐grade serous carcinoma cells with low SMARCA4 expression and high SMARCA2 expression contribute to platinum resistance2023

    • Author(s)
      Kido Kansuke、Nojima Satoshi、Motooka Daisuke、Nomura Yusuke、Kohara Masaharu、Sato Kazuaki、Ohshima Kenji、Tahara Shinichiro、Kurashige Masako、Umeda Daisuke、Takashima Tsuyoshi、Kiyokawa Hiroki、Ukon Koto、Matsui Takahiro、Okuzaki Daisuke、Morii Eiichi
    • Journal Title

      The Journal of Pathology

      Volume: 260 Pages: 56~70

    • DOI

      10.1002/path.6064

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Class IV semaphorins in disease pathogenesis2022

    • Author(s)
      Nojima Satoshi
    • Journal Title

      Pathology International

      Volume: 72 Pages: 471~487

    • DOI

      10.1111/pin.13270

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Semaphorin 6D?expressing mesenchymal cells regulate IL-10 production by ILC2s in the lung2022

    • Author(s)
      Naito Maiko、Nakanishi Yoshimitsu、Motomura Yasutaka、Takamatsu Hyota、Koyama Shohei、Nishide Masayuki、Naito Yujiro、Izumi Mayuko、Mizuno Yumiko、Yamaguchi Yuta、Nojima Satoshi、Okuzaki Daisuke、Kumanogoh Atsushi
    • Journal Title

      Life Science Alliance

      Volume: 5 Pages: 1486

    • DOI

      10.26508/lsa.202201486

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Novel Three-Dimensional Imaging System Based on Polysaccharide Staining for Accurate Histopathological Diagnosis of Inflammatory Bowel Diseases2022

    • Author(s)
      Nojima Satoshi、Ishida Shoichi、Terayama Kei、Matsumoto Katsuhiko、Matsui Takahiro、Tahara Shinichiro、Ohshima Kenji、Kiyokawa Hiroki、Kido Kansuke、Ukon Koto、Yoshida Shota Y.、Mitani Tomoki T.、Doki Yuichiro、Mizushima Tsunekazu、Okuno Yasushi、Susaki Etsuo A.、Ueda Hiroki R.、Morii Eiichi
    • Journal Title

      Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology

      Volume: 14 Pages: 905~924

    • DOI

      10.1016/j.jcmgh.2022.07.001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 組織病理学に寄与する先端イメージング技術2023

    • Author(s)
      野島聡
    • Organizer
      第112回 日本病理学会総会・特別企画:病理専門医が得られる研究マインド
    • Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 組織又は細胞中のグリコール基を含む物質を特異的に染色する蛍光染色方法2022

    • Inventor(s)
      野島聡 他
    • Industrial Property Rights Holder
      野島聡 他
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      GCP21188

URL: 

Published: 2023-12-25  

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