Exploring genetic factors that define TDP-43 pathological polymorphisms in ALS.

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K07272
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 51030:Pathophysiologic neuroscience-related
• Research Institution: Niigata University
• Principal Investigator: Ishihara Tomohiko 新潟大学, 脳研究所, 特任准教授 (70612232)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 他田 真理 新潟大学, 脳研究所, 准教授 (30646394)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: ALS / TDP-43 / エクソーム解析 / テキストマイニング

Outline of Final Research Achievements

The aim of this study was to perform a comprehensive genetic analysis (exome analysis) using DNA from amyotrophic lateral sclerosis (ALS) autopsy cases to identify factors that define TDP-43 pathological polymorphism. In 3 years of this study period, we performed exome analysis in 23 new cases. In this analysis, including 137 previously analyzed cases, we found mutations in specific exons of gene X in 9 cases. These 9 cases were rapidly progressive with poor prognosis (median survival: 15 months), and 5 cases showed TDP-Type2a pathology. Thus, the mutation may be a determinant of the type of pathology and prognosis.

Free Research Field

医歯薬学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ALSは根治的治療が未開発の進行性運動神経変性疾患である。本邦の症例はおよそ10,000人と推測され、多くの例では3-5年で死亡ないし持続的な人工呼吸器使用が必要となる。一方で本疾患の進行速度は症例により多様であり、急速進行例から10年以上の長期経過例までさまざまである。ALSでは30以上の原因遺伝子が同定されており、遺伝性背景の重要な疾患である。本研究で実施した進行速度に影響しうる遺伝子的背景を解析することは、その病態生理の理解、予後評価、治療法開発に貢献しうるものである。