悪性リンパ腫におけるT細胞受容体レパトアと免疫微小環境の解析

2023 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21K07407
• Research Institution: Tokyo Metropolitan Hospital Organization Tokyo Metropolitan Komagome Hospital
• Principal Investigator: 金政 佑典 地方独立行政法人東京都立病院機構東京都立駒込病院(臨床研究室), 腫瘍内科, 医長 (30868633)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 下山 達 地方独立行政法人東京都立病院機構東京都立駒込病院(臨床研究室), 腫瘍内科, 部長 (70450591) ; 大保木 啓介 公益財団法人東京都医学総合研究所, ゲノム医学研究センター, 副参事研究員 (80415108)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 悪性リンパ腫 / 腫瘍免疫微小環境 / T細胞受容体レパトア

Outline of Annual Research Achievements

腫瘍の免疫微小環境は、臨床転帰や治療効果に影響を及ぼすことが示されている。免疫プロファイルに基づく予後指標を開発するために、われわれはThe Cancer Genome Atlas（TCGA）のびまん性大細胞型B細胞リンパ腫（DLBCL）のRNA-seq生データを再解析し、TCGAの以前の大規模研究を利用した。T細胞受容体（TCR）の多様性が低い患者は、多様性が高い患者よりも無増悪期間（PFI）が有意に良好であった（TCRα：P = 0.048、TCRβ：P = 0.027）。TCRの多様性は、特に多様性が狭いものでは、シーケンスリードの数に強く影響された。TCRシーケンシングリードの数が少ない症例におけるTCR多様性の過小評価を克服するために、関連するT細胞サブセットの含有率とTCR多様性の組み合わせを試みた。TCR多様性は、CIBERSORT由来の制御性T細胞（Treg）仮想分画と関連した。Treg割合とTCR多様性の組み合わせは、最も短いPFIを有する患者を層別化することに成功した（P = 0.002）。仮想Treg分画の代用として、TCR多様性に関連する免疫関連因子を探索した。ロジスティック回帰モデルを用いて、最終的に2つの遺伝子を選択し、仮想Treg分画を説明するスコアリングシステム（「TICKスコア」）を開発した（ROC曲線下面積：0.849、95％CI：0.731-0.967）。TICKスコアが低く、TCR多様性が高い患者は、他の組み合わせに比べてPFIが非常に短かった（P = 0.012）。TCR DIとTICKスコア／仮想TCRスコアの組み合わせは、PFIを有意に短縮した（P = 0.012）。