Development of biomarker for postpartum depression using GWAS and metabolomics

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K07479
• Research Institution: Nagoya University
• Principal Investigator: 高橋 長秀 名古屋大学, 医学部附属病院, 准教授 (50846714)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 富田 博秋 東北大学, 医学系研究科, 教授 (90295064)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 産後うつ病 / GWAS / メタボローム

Outline of Annual Research Achievements

名古屋大学および関連病院から収集された妊産婦1002検体（50 ng/ul）を東北大学に送付し、東北大学にて Axiom_TMMJPAv3 SNPアレイ（Japonica array NEO）を用いて65万SNPをgenotypingした。日本人リファレンスパネル(4.2KJPN)を元にインピューテーションを行い、Quality Control(Hardy-Weinberg Equilibrium解析, imputation精度)を行い 、頻度1％以上の618万SNPについてgenotypingデータを取得し、複数回出産をしている妊婦については、初産のデータのみを使用した。IBD解析を行い、血縁関係にある妊婦を対象から除外し、PCA解析によりPopulation stratification analysisを行い、PC1-10および産前のうつ状態をcovariateとして産後うつ病発症群 vs 産後うつ病未発症群で関連解析を行い、染色体9番のABO遺伝子上に位置するSNPがゲノムワイドに有意な関連を示すことを見出した。現在、東北メディカルメガバンクの検体を用いて、replicationを行なっている。この結果をもとに論文を発表する予定である。

メタボローム解析については、妊娠中・産後を通じて抑うつ状態の見られなかった妊産婦と産後にのみうつ状態の見られた妊産婦の血漿中の代謝物170について解析を行った。結果として、7つの代謝物が、産前・産後において変化していることを見出し、産後うつ病の病態に関連していることが示唆された。今後はこれらのデータを元に産後うつ病の発症予測モデルを構築する。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

論文の核となるデータが揃いつつある。

Strategy for Future Research Activity

ゲノムワイドに有意な関連が見られたため、gene-wide解析、gene-enrichment解析なども追加して行い、産後うつ病の病態に関与していることが想定される遺伝子パスウェイの同定も試みる。

Causes of Carryover

学会発表を予定していたが、コロナ禍で中止となったため。次年度は学会発表を予定しており、英文校正、論文掲載費として使用する予定である。