2023 Fiscal Year Annual Research Report
糖脂質代謝異常にフォーカスした多層オミックス解析による糖尿病関連肝発癌機構の解明
Project/Area Number |
21K07896
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Research Institution | Hiroshima University |
Principal Investigator |
相方 浩 広島大学, 医系科学研究科(医), 専門研究員 (30403512)
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Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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Keywords | 肝癌 / 非ウイルス性 / 糖尿病 / 生活習慣病 |
Outline of Annual Research Achievements |
近年、HBV、HCV感染のない非肝炎ウイルス性肝癌患者が増加しているが、これらの患者の多くは、糖・脂質代謝異常をはじめとする生活習慣病を合併していることが判明している。本研究では、糖・脂質代謝異常に関連の深いメタボローム、リピドーム、そしてメタゲノム情報を追加して、これまでに蓄積された複数のオミックス情報を統合し、非肝炎ウイルス性肝発癌高リスク群の囲い込みに有用なバイオマーカー同定など、臨床応用に資する成果の創出を目指した。 まず、2型糖尿病を有する症例について解析対象症例、臨床情報の集積および検体の選定を行い、糖尿病罹病期間、治療内容、肝線維化や脂肪肝の程度などの臨床情報を集積し、肝発癌の有無により、層別化した。これらの対象症例の糞便検体を収集して、DNAを抽出し、腸内細菌叢解析として、16S rRNAの標的配列を増幅し、次世代シークエンサーで塩基配列を決定した。可変領域の相同性を細菌データベースの参照配列に照らし、分類・同定を行い、組成比を評価した。さらに、血液検体を質量分析装置にかけて、メタボロミクス解析およびリピドミクス解析を行った。それぞれ単層での解析を行い、主成分分析や階層・非階層クラスター分析など多変量解析の手法を用いて探索的な検討を行った。最終的には、過去の研究あるいは本研究により得られた単層データについて、各層の相関関係を基本として、ネットワーク解析による情報の統合・集約を試みるトランスオミックス解析を行う方針であり、現在、さらに症例とサンプルを集積して解析の継続を行っている。
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Research Products
(1 results)
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[Journal Article] Impact and usefulness of the transition to the new MAFLD classification for non-B, non-C HCC: a retrospective cohort study2023
Author(s)
Johira Y, Nakahara T, Kinami T, Yamasaki S, Kosaka M, Shirane Y, Miura R, Murakami S, Yano S, Amioka K, Naruto K, Ando Y, Kosaka Y, Kodama K, Uchikawa S, Fujino H, Ono A, Murakami E, Okamoto W, Yamauchi M, Kawaoka T, Hayes CN, Tsuge M, Imamura M, Aikata H, Oka S
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Journal Title
BMC Gastroenterology
Volume: 23
Pages: 23(1):222
DOI
Peer Reviewed