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2021 Fiscal Year Research-status Report

Mechanism on epigenetic carcinogenesis of EB virus-gastric cancer focused on senescence

Research Project

Project/Area Number 21K07934
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

関 元昭  千葉大学, 医学部附属病院, 特任助教 (70714278)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsEBウイルス胃癌
Outline of Annual Research Achievements

胃癌のサブグループであるEpstein-Barrウイルス陽性胃癌(EBV胃癌)は、EBウイルスへの感染と、それに続くDNAメチル化によって癌抑制遺伝子が不活性化され発癌に至る。しかし、上皮細胞へのウイルス感染から発癌至るエピゲノム制御は明らかではない。申請者らは、EBウイルス感染細胞が細胞老化様の表現型を示すことを観察したことから、EBV感染によって細胞老化が惹起されており、老化を回避する細胞が癌化に至るとの仮説を立てた。そこで本研究ではEBV胃癌発癌の分子メカニズムを明らかにするために、EBウイルス感染細胞を表現型に基づいて分取し、遺伝子発現解析、DNAメチル化解析から発癌ドライバー遺伝子を同定する。
まず、EBウイルス感染細胞において細胞老化が誘導されるか検討した。EBウイルスを感染させた胃癌細胞株および正常胃粘膜上皮細胞株において酸性ガラクトシダーゼ活性の検出を行い、細胞老化様の表現型観察を試みた。しかし、EBウイルス感染によるガラクトシダーゼ陽性細胞の増加は見られなかった。次に、細胞核を染色後、セルソーターを用いて細胞核の大きさ毎に細胞を分取し、その増殖速度を観察したが、有意な差異は見いだせなかった。そのため、一般的な細胞老化とは異なるメカニズムで増殖抑制が生じていると考えられた。今後、改めてEBウイルス感染による、細胞表現型への影響を探索し、それらの原因について解析する。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

酸性β-ガラクトシダーゼ活性測定において有意な老化の誘導は観察されなかった。また、細胞核を染色後、セルソーターを用いて細胞核の大きさ毎に細胞を分取し、その増殖速度を観察したが、有意な差異は見いだせなかった。
そこで、新たに、EBウイルス感染後に、細胞間の不均一性に由来する表現型を探索することにした。ピューロマイシン耐性遺伝子の下流にランダムな配列のDNAバーコードをクローニングし、転写型DNAバーコードライブラリを作成した。これを用いてレンチウイルスを作成し、GES1細胞に感染させ、DNAバーコードを発現するGES1細胞を樹立した。

Strategy for Future Research Activity

樹立したDNAバーコード発現型GES1細胞を用いて、EBウイルス感染実験を行う。陰性コントロールとして、薬剤耐性遺伝子のみを発現するプラスミドをトランスフェクションした細胞も準備する。EBウイルス感染もしくはプラスミド導入の4週間後に細胞からゲノムDNAを回収し、DNAバーコード配列をシークエンサーで解読する。両者での集団の割合が類似していれば、EBウイルス感染は確率論的に発生する事象であると考えられ、また、異なるバーコードの濃縮が見られた場合は、細胞間あるいはクローン間での何らかのバイアスが予想される。バイアスの存在が示唆された場合には、その原因解明のため、一細胞解析等を検討する。

  • Research Products

    (6 results)

All 2022 2021

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Barcode fusion genetics-protein-fragment complementation assay (BFG-PCA): tools and resources that expand the potential for binary protein interaction discovery2022

    • Author(s)
      Evans-Yamamoto Daniel、Rouleau Francois D、Nanda Piyush、Makanae Koji、Liu Yin、Despres Philippe C、Matsuo Hitoshi、Seki Motoaki、Dube Alexandre K、Ascencio Diana、Yachie Nozomu、Landry Christian R
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/nar/gkac045

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Neutralization of the SARS-CoV-2 Mu Variant by Convalescent and Vaccine Serum2021

    • Author(s)
      Uriu Keiya、Kimura Izumi、Shirakawa Kotaro、Takaori-Kondo Akifumi、Nakada Taka-aki、Kaneda Atsushi、Nakagawa So、Sato Kei
    • Journal Title

      New England Journal of Medicine

      Volume: 385 Pages: 2397~2399

    • DOI

      10.1056/NEJMc2114706

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] CRISPR/Cas9-mediated base-editing enables a chain reaction through sequential repair of sgRNA scaffold mutations2021

    • Author(s)
      Fukushima Tsuyoshi、Tanaka Yosuke、Adachi Keito、Masuyama Nanami、Tsuchiya Akiho、Asada Shuhei、Ishiguro Soh、Mori Hideto、Seki Motoaki、Yachie Nozomu、Goyama Susumu、Kitamura Toshio
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-021-02986-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Machine learning approach for discrimination of genotypes based on bright-field cellular images2021

    • Author(s)
      Suzuki Godai、Saito Yutaka、Seki Motoaki、Evans-Yamamoto Daniel、Negishi Mikiko、Kakoi Kentaro、Kawai Hiroki、Landry Christian R.、Yachie Nozomu、Mitsuyama Toutai
    • Journal Title

      npj Systems Biology and Applications

      Volume: 7 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41540-021-00190-w

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] TET1 upregulation drives cancer cell growth through aberrant enhancer hydroxymethylation of HMGA2 in hepatocellular carcinoma2021

    • Author(s)
      Shirai Kiyokazu、Nagae Genta、Seki Motoaki、Kudo Yotaro、Kamio Asuka、Hayashi Akimasa、Okabe Atsushi、Ota Satoshi、Tsutsumi Shuichi、Fujita Takanori、Yamamoto Shogo、Nakaki Ryo、Kanki Yasuharu、Osawa Tsuyoshi、Midorikawa Yutaka、Tateishi Keisuke、Ichinose Masao、Aburatani Hiroyuki
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 112 Pages: 2855~2869

    • DOI

      10.1111/cas.14897

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Book] 超生物学―次のX2021

    • Author(s)
      谷内江 望、谷内江研究室
    • Total Pages
      189
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-2252-8

URL: 

Published: 2022-12-28  

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