Elucidation of the mechanism and pathway for duodenal carcinogenesis related to dysbiosis of duodenal mucosa-related microbiota

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K07947
• Research Institution: Kyoto Prefectural University of Medicine
• Principal Investigator: 土肥 統 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (60599752)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 廣瀬 亮平 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50795383) ; 高木 智久 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (70405257)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 十二指腸粘膜由来細菌叢 / オルガノイド / メタゲノム / メタボローム

Outline of Annual Research Achievements

十二指腸癌の頻度が増加してきている要因として、内視鏡機器の進歩、食生活様式の変化、Helicobacter pylori感染率の低下などが予想されるが、現在十二指腸癌は治療法が確立しておらず、その発症リスク、病態、予防法の解明は重要な課題である。本研究では十二指腸癌と関連する十二指腸粘膜由来細菌叢（duodenal mucosa-associated microbiota: D-MAM）から産生される腸内細菌叢由来発癌関連因子による十二指腸粘膜の遺伝子・分子異常について、腸管オルガノイド技術を駆使して解析し、十二指腸癌の早期発見や予防につながる先制医療の戦略開拓を行う予定である。十二指腸内視鏡検査において十二指腸癌患者および非癌患者を選定し、それぞれ50例において、内視鏡下の粘膜ブラシ検体サンプリングを行った。回収した粘膜ブラシ検体から次世代シークエンサーを用いて16S rRNAメタゲノム解析を行い、大量の配列を取得し、相同性検索および系統分類解析を実施中である。十二指腸癌患者に増加あるいは減少している細菌叢が十二指腸発癌に関わっている可能性があり、メタボローム解析を行い、十二指腸粘膜由来細菌叢における代謝経路、MAM新規代謝物を同定する。また、サンプ
ルよりサイトカイン、mRNA発現による遺伝子発現解析を行い、十二指腸癌発癌に繋がる新規候補代謝物・遺伝子産物の同定を行う予定である。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

COVID19の影響で検体採取が遅れており、その影響で解析がやや進んでいない。
臨床検体を集め、メタボローム解析を進める。

Strategy for Future Research Activity

メタゲノム解析が終了次第、メタボローム解析を進める。同時に剖検体から得られた十二指腸上皮オルガノイドを培養し、樹立する方法を確立する。

Causes of Carryover

臨床検体の集積が予想よりも遅くなり、メタボローム解析のための使用額が少なくなってしまった。
臨床検体を集め、メタボローム解析を進める。