2023 Fiscal Year Research-status Report
CTC-chipからの循環腫瘍細胞単離と遺伝子変異検索の臨床的有用性
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21K08219
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| Research Institution | University of Occupational and Environmental Health, Japan |
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Principal Investigator |
森 將鷹 産業医科大学, 医学部, 助教 (70816016)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田中 文啓 産業医科大学, 医学部, 教授 (10283673)
小山 倫太郎 産業医科大学, 医学部, 助教 (70894088)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | 循環腫瘍細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
患者の予後を規定するのは転移であり、その転移巣を形成するのは血中に遊離した腫瘍細胞、すなわち循環腫瘍細胞である。循環腫瘍細胞の捕捉は圧倒的多数の正常血球が存在することにより通常困難であるが、我々はバイオマーカーとしての循環腫瘍細胞に着目し、効率的な循環腫瘍細胞の捕捉を実現してきた。本研究ではこれまで研究手法をさらに発展させ、捕捉した循環腫瘍細胞のみを単離し、遺伝子解析可能な実験系を構築し、循環腫瘍細胞におけるEGFR阻害剤投与後の耐性変異検出などについて検討することで循環腫瘍細胞の遺伝子解析の臨床的有用性について評価することを目的としている。循環腫瘍細胞の遺伝子解析においては通常白血球の混入が問題となる。白血球とともに遺伝子解析を行うことによって癌細胞特有の遺伝子変異検出が困難になるからである。そこで、我々はマイクロマニピュレーターを導入し、諸々の条件設定を最適化し白血球の混入なく循環腫瘍細胞単離が行える実験系を構築した。循環腫瘍細胞単離の後に、PCRによって既知の遺伝子変異を検出することが実現した。同様の手法で単離した循環腫瘍細胞において次世代シークエンサーにより広範な遺伝子解析を行うに当たり、細胞の処理方法等の諸条件が影響し、一つの細胞のDNAすなわち極少量のテンプレートから広範な遺伝子解析を行うには十分ではないcoverageであることが判明し、細胞処理の諸条件を最適化することで十分なcoverageが得られるようになった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
単一細胞から次世代シークエンサーを用いた広範な遺伝子解析を行うには、細胞処理の段階での諸条件が解析に悪影響を及ぼすことが明らかになり、この諸条件を最適化するために時間を要しやや遅れていると判断している。
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| Strategy for Future Research Activity |
細胞処理の諸条件を最適化した上で、臨床検体における解析を実施し循環腫瘍細胞の遺伝子解析の臨床的有用性について検討する。
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| Causes of Carryover |
最適条件について検討に時間を要したため進行が遅れ次年度使用額が生じた。差額は次年度での臨床検体における検討のため使用する。
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[Presentation] 高分子マイクロ流体デバイスCTC-chipを利用したsingle cellのターゲットシーケンス2023
Author(s)
小山倫太郎, 荒木真一, 古賀裕之, 小林美苑, 田中完治, 眞鍋尭彦, 梶山健太, 吉松克真, 根本有希子, 松宮弘喜, 西澤夏將, 本多陽平, 森將鷹, 金山雅俊, 平良彰浩, 桒田泰治, 竹中 賢, 田嶋裕子, 黒田耕志, 田中文啓
Organizer
第40回日本呼吸器外科学会学術集会
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