罹患組織の単細胞RNAシーケンス解析を起点としたIgG4関連疾患の病態の解明

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K08436
• Research Institution: Chiba University
• Principal Investigator: 池田 啓 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (10456014)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 岩田 有史 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (90436353) ; 中島 裕史 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (00322024)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: IgG4関連疾患 / 単細胞RNAシークエンス / 顎下腺 / 疾患特異的細胞 / バイオマーカー

Outline of Annual Research Achievements

IgG4-RD患者3例ならびに非自己免疫性疾患患者3例の顎下腺の生検検体を採取し、血球系細胞(CD45+) および非血球系細胞 (CD45-) を、フローサイトメトリーを用いて単離し、それぞれscRNA-seq解析 (10x Genomics) を実施し、検体の品質に問題がないことを確認した。現在その結果を解析中である。また、同症例のPBMCはライブラリ作成済である。
上記患者とは別に、治療開始あるいは治療強化前のIgG4-RD患者4例を前向きコホートに組み入れ、臨床情報と末梢血検体を収集している。またコントロール群として未治療シェーグレン症候群2例、健常者2例の末梢血検体を保存している。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

新型コロナパンデミックにより、耳鼻咽喉科外来における生検が一時期停止したため、起点となるscRNAseq用生検検体の準備が遅れた。

Strategy for Future Research Activity

組織およびPBMCのscRNAseq解析を急ぎ、その結果に基づき、マウス実験のセットアップ、バイオマーカー候補の選出を行う。引き続きIgG4-RDの前向き治療コホート、コントロール症例の集積を続ける。

Causes of Carryover

PBMCのscRNAseqが未実施であること、マウス実験のセットアップが開始できていないことにより次年度使用額が生じた。計画通りに使用予定である。