2023 Fiscal Year Annual Research Report
Identification and functional analysis of novel type 1 diabetogenic genes in the Japanese population by next-generation sequencing
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21K08567
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| Research Institution | Kindai University |
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Principal Investigator |
能宗 伸輔 近畿大学, 医学部, 准教授 (90460849)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池上 博司 近畿大学, 医学部, 教授 (20221062)
馬場谷 成 近畿大学, 医学部, 講師 (10449837)
廣峰 義久 近畿大学, 医学部, 講師 (30460851)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | １型糖尿病 / 遺伝子解析 / 次世代シーケンス / 濃厚発症家系 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
１型糖尿病は多因子疾患（common disease）であり、その遺伝素因は効果量の小さい疾患感受性遺伝子が多数集積して校正される。しかし我が国の１型糖尿病は欧米に比し有病率が低く、また家族内集積率は高い傾向がある。本研究は有病率が高い欧米と本邦における疫学的特徴の差異に着目し、Common diseaseの発症に関わるありふれた変異（common variant）とは別に、頻度は低いが効果量の大きい新規Rare varinatを見いだすことにより、我が国特有の遺伝素因を分子レベルで解明することを目的としている。寄与率の低いCommon variantの同定には大規模サンプルを集積する必要があるが有病率が低い我が国では困難である。一方で一家系に複数の１型糖尿病発症者を有する家系を対象とすると、大きな効果量をもつrare variantを同定できる可能性がある。我々はこれまで着実に濃厚発症家系の集積を進めており、昨年度時点で15家系54名（罹患者35名、非罹患者19名）であった対象者は、17家系62名（罹患者40名、非罹患者22名）となった。対象者の全エクソームシーケンス（WES）作業をは完了し、初年度に独立基盤形成支援にともなう交付決定後増額を得たことにより各家系の発端者に対して全ゲノムシーケンス（WGS）をおこなうことで、WESだけでは検出し得ない、染色体上の大きな構造変異の探索やミスアライメントの検証など変異解析の精度を飛躍的に向上させることができた。
現状、次世代シーケンス解析によって同定された遺伝子変異が偽陽性である可能性を除外するため、サンガー法を用いたDirect sequencing、およびにTaqman法を用いて遺伝子型を決定する作業をおこなっており、また家族性１型糖尿病と弧発例１型糖尿病におけるＨＬＡハプロタイプの差異については論文執筆中である。
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[Journal Article] New diagnostic criteria (2023) for slowly progressive type 1 diabetes (SPIDDM): Report from Committee on Type 1 Diabetes in Japan Diabetes Society (English version)2024
Author(s)
Shimada A, Kawasaki E, Abiru N, Awata T, Oikawa Y, Osawa H, Kajio H, Kozawa J, Takahashi K, Chujo D, Noso S, Fukui T, Miura J, Yasuda K, Yasuda H, Imagawa A, Ikegami H.
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Journal Title
J Diabetes Investig.
Volume: 15
Pages: 254-257
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Prediction of future insulin-deficiency in glutamic acid decarboxylase autoantibody enzyme-linked immunosorbent assay-positive patients with slowly-progressive type 1 diabetes2024
Author(s)
Kawasaki E, Awata T, Ikegami H, Imagawa A, Oikawa Y, Osawa H, Katsuki T, Kanatsuna N, Kawamura R, Kozawa J, Kodani N, Kobayashi T, Shimada A, Shimoda M, Takahashi K, Chujo D, Tsujimoto T, Tsuchiya K, Terakawa A, Terasaki J, Nagasawa K, Noso S, Fukui T, Horie I, Yasuda K, Yasuda H, Yanai H, Hanafusa T, Kajio H
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Journal Title
J Diabetes Investig.
Volume: 15
Pages: online
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Glycemic Excursion and Insulin Action Revealed in a Rare Case of Type 1 Diabetes Complicated with Short Bowel Syndrome2023
Author(s)
Hiromine Y, Noso S, Babaya N, Taketomo Y, Niwano F, Okuda Y, Yasutake S, Minohara T, Tsuda N, Hama Y, Ikegami H.
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Journal Title
Intern Med.
Volume: 107
Pages: 1023-1029
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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