2022 Fiscal Year Research-status Report
乳がんのネオアンチゲンにおけるHLA Class II拘束性ペプチドの網羅的探索
| Project/Area Number |
21K08614
|
|---|
| Research Institution | University of Tsukuba |
|---|
Principal Investigator |
坂東 裕子 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (00400680)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
宮寺 浩子 筑波大学, 医学医療系, 助教 (40361464)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
|
| Keywords | neoantigen / HLA class II / 抗腫瘍免疫 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、ホルモン感受性（HR+）難治性乳癌のpublic neoantigenからHLA class IIに提示されうるペプチド配列を見出すことである。抗腫瘍免疫には細胞傷害性T細胞だけでなくHLA class IIとヘルパーT細胞による免疫応答も中心的な役割を担うことがよく知られているが、HR+難治性乳癌が免疫療法の標的となるかは明らかにされていない。患者間共通のpublic neoantigenの中からT細胞に認識されるHLA class II拘束性ペプチドが同定されれば、汎用性の高い治療標的となりうる。そこで、HLA class IIとHR+乳癌で共有されるpublic neoantigenとの相互作用を測定し標的可能性を探索した。これまでにHLA class II拘束性ペプチドを計算機上で予測するアルゴリズムの開発が行われているが、予測精度が低いことが長年の課題であった。本研究ではHLA class II-ペプチド複合体の安定性を細胞表面発現量で評価する新規測定系を用いて、HLA class IIが提示しうるpublic neoantigenを探索する。令和3年度は、HR+難治性乳癌で共有されるpublic neoantigenから設計した変異ペプチドとHLA class IIとの結合性を新規測定系を用いて評価した。令和４年度は、結合性が高いと予測された領域に関して野生型配列との結合性を比較し、低い領域はHLA class IIアレルを変更して結合性を再評価した。また、T細胞による認識の有無（免疫原性）を確認するため、変異ペプチドと強い結合を示すHLA class IIアレルを有する健常ドナーの末梢血単核細胞(PBMC)を用いてEnzyme-Linked ImmunoSpot (ELISpot)アッセイを行うための予備検討を開始した。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
臨床応用されているがん遺伝子パネル検査であるFoundationOne CDx, FoundationOne Liquid CDx(Foundation Medicine, Inc.), NCC oncopanel (Agilent)に登録されている遺伝子を中心に、COSMIC (Catalogue of Somatic Mutations in Cancer)のデータベースを用いて候補領域を検索した。乳癌で頻度の高い体細胞遺伝子変異（合計２遺伝子、18変異）を選択し、HLA class II アレルは日本人集団で頻度が高いものを解析対象とし、計算機上でHLA-ペプチド結合予測を行った（NetMHCIIpan4.0）。そして、研究分担者らが最近開発したMHC-ペプチド結合アッセイを用いて、結合性が予測される候補ペプチドとHLA class IIとの相互作用を測定した。その結果、HLA class IIに比較的強く結合しうる変異ペプチドを合計12種類認めた。結合性が高いと予測された領域に関して野生型配列との結合性を比較し、低い領域はHLA class IIアレルを変更して結合性を再評価した。その結果、結合性が高いと予測されるHLA class IIと変異ペプチドの組み合わせが16種類認められた。現在、T細胞による認識の有無（免疫原性）を確認するため、変異ペプチドと強い結合を示すHLA class IIアレルを有する健常ドナーの末梢血単核細胞(PBMC)を用いて、Enzyme-Linked ImmunoSpot (ELISpot)アッセイを行い、実験条件検討中である
|
| Strategy for Future Research Activity |
野生型・変異型間とも同等に結合能が強い領域については、HLA-ペプチド複合体での変異部位の位置を推測する。また、他の結合能を示すHLA class IIアレルを有する健常ドナーのPBMCを用いて、ELISpotアッセイを行う。
|
