2021 Fiscal Year Research-status Report
EBV関連胃癌におけるエピゲノム異常によるARID1A遺伝子の発現制御機序の解明
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21K08675
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| Research Institution | Fukushima Medical University |
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Principal Investigator |
齋藤 元伸 福島県立医科大学, 医学部, 講師 (90611749)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | EBV関連胃癌 / エピゲノム異常 / ARID1A遺伝子変異 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
まず、EBV関連胃癌におけるDNAプロモーターメチル化状態の解析をGEOに登録されたメチレーションアレイを用いておこなった。その結果、EBV関連胃癌はEBV陰性胃癌と比べて非常に多くの遺伝子が高メチル化状態であった。同様に、MKN7胃癌細胞に実験的にEBVを感染させた細胞［EBV（+）＃1～＃3］はコントロール細胞［EBV(-)］と比べて、高メチル化状態であることが確認された。これらの結果から、EBV感染自体が細胞内の遺伝子のメチル化を促すことが確認された。今後は、これらのアレイデータを用いてARID1A遺伝子のメチル化の特徴・その程度の把握をおこなう。同時にmRNAの発現解析をおこなった発現マイクロアレイ（GSE31787）と比較することで、DNAメチル化に伴う遺伝子発現異常を把握することができる。In silico解析結果の検証のために自施設で切除された胃癌検体をメチレーションアレイとmRNA発現アレイにかけて解析する。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
解析に用いるマイクロアレイデータをGEOデータベースからダウンロードして、EBV関連胃癌におけるDNAメチル化状態の解析を始めることができている。また、EBV関連胃癌における遺伝子発現のマイクロアレイもGEOデータベースからダウンロードして、メチル化データと合わせての解析を始めているため。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、GEOからダウンロードしたアレイデータを用いてARID1A遺伝子のメチル化の特徴・その程度の把握をおこなう。同時にmRNAの発現解析をおこなった発現マイクロアレイ（GSE31787）と比較することで、DNAメチル化に伴う遺伝子発現異常を把握することができる。In silico解析結果の検証のために自施設で切除された胃癌検体をメチレーションアレイとmRNA発現アレイにかけて解析する。また、EBV関連胃癌におけるEBVマイクロRNA発現のマイクロアレイデータをGEOデータベースで探してダウンロードしていく予定である。
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| Causes of Carryover |
データベース解析を主とした解析研究を始めており、細胞実験や免疫組織学的染色実験は以前の研究の残余分を使用している。次年度には残余分がなくなるため、本研究費から購入していく予定である。
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