Comprehensive genomic analysis of esophagogastric junction adenocarcinoma for treatment inovation

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K08736
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 55020:Digestive surgery-related
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: Harada Kazuto 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 特定研究員 (70608869)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 馬場 秀夫 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 教授 (20240905) ; 岩槻 政晃 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 助教 (50452777) ; 今村 裕 公益財団法人がん研究会, 有明病院 消化器外科, 医長 (70583045)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 食道胃接合部腺癌 / 次世代シークエンサー / がんゲノム / 個別化治療

Outline of Final Research Achievements

DNA and RNA were corrected from 40 frozen pretreatment tissue of esophagogastric junction adenocarcinoma treated with chemoradiotherapy. Twenty cases had complete response, and 20 cases had resistant for treatment. After quality check of RNA, RNA sequencing was performed by using NovaSeq6000.
In complete response group, we compared RNA expression between cases with and without recurrence. We finally found out that 74 genes were upregulated in recurrent group and 23 genes were upregulated in non-recurrent group. These genes could be associated with efficacy of treatment and potencially targets for new treatments.

Free Research Field

がんゲノム

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

我々は食道胃接合部腺癌において、化学放射線療法で完全寛解した症例と抵抗性を示した症例のゲノムを網羅的に解析した。完全寛解した症例で再発した症例と再発しなかった症例を比較すると、再発症例で有意に増加している遺伝子が７４種類、再発しなかった症例で有意に増加している遺伝子２３種類が同定された。これらの遺伝子は新たな治療ターゲットや予後規定因子になり得る可能性がある。研究を継続して治療に最も影響を及ぼす遺伝子を同定することができれば、新たな治療薬の発明に寄与すると考えられる。