2023 Fiscal Year Annual Research Report
Integrative proteomic analysis of PDX models to develop targeted therapies in gastric cancer
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21K08765
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| Research Institution | Aichi Cancer Center Research Institute |
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Principal Investigator |
伊藤 友一 愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 研究員 (80397463)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
細田 和貴 愛知県がんセンター(研究所), がん情報・対策研究分野, 研究員 (00728412)
田口 歩 愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 分野長 (50817567)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 胃癌 / PDXモデル / PDC / プロテオミクス / 細胞表面タンパク質 / HLAクラスI結合ペプチド / 腫瘍浸潤リンパ球 / 個別化がんワクチン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
早期胃癌の多くは根治が期待できるのに対し、遠隔転移を伴う進行胃癌はもっとも予後が不良な固形癌のひとつである。近年のゲノム解析技術の目覚ましい進歩にもかかわらず、進行胃癌の有効な化学療法は限られており、革新的なアプローチによる新規治療法の開発が急務である。本研究では、外科手術検体から胃癌患者腫瘍組織移植（patient-derived xenograft; PDX）モデルを作成し、細胞表面タンパク質（サーフェスオーム）解析から下流の活性化シグナル経路同定のためのリン酸化タンパク質解析まで含む高深度な多層プロテオーム解析によって、新規治療標的分子や薬剤感受性予測バイオマーカーの探索同定を行った。現在までに、胃癌18症例についてPDXモデルを作成し、このうち9症例においては、さらに患者腫瘍由来細胞株（PDC）を樹立できた。PDX腫瘍、PDCそれぞれにおいて、ゲノム、トランスクリプトーム、サーフェスオームを含む空間プロテオーム解析を行い、他癌種PDX腫瘍や正常胃粘膜組織の多層オミクスデータとの比較から、胃癌分子シグネチャの同定を進めている。また、11症例において、PDXモデルと腫瘍浸潤リンパ球がペアとして得られた。これらのPDX腫瘍においては、我々が開発した高感度HLAリガンドーム解析を行い、同定されたHLAクラスI結合ペプチドについて免疫原性の検証を進めている。
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