Integrative proteomic analysis of PDX models to develop targeted therapies in gastric cancer

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K08765
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 55020:Digestive surgery-related
• Research Institution: Aichi Cancer Center Research Institute
• Principal Investigator: Yuichi Ito 愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 研究員 (80397463)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 細田 和貴 愛知県がんセンター(研究所), がん情報・対策研究分野, 研究員 (00728412) ; 田口 歩 愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 分野長 (50817567)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 胃癌 / PDXモデル / 患者由来細胞 / プロテオミクス / 細胞表面タンパク質 / HLAクラスI結合ペプチド / 腫瘍浸潤リンパ球 / 個別化がんワクチン

Outline of Final Research Achievements

While most early-stage gastric cancers can be cured by surgery, effective chemotherapy for advanced gastric cancer is limited and there is an urgent need to develop innovative therapies. In this study, we will develop patient-derived xenograft (PDX) models of gastric cancer and a comprehensive multi-omics analysis of PDX tumors will be performed, including cell surfaceome and phosphoproteome analysis that focus on the identification of activated signalling pathways. In addition, HLA ligandome analysis will be performed to identify highly immunogenic HLA class I peptides that can be used for personalized cancer vaccine therapy. The aim is to overcome advanced gastric cancer by elucidating the molecular background of gastric cancer and identifying a set of cell surface molecules as innovative therapeutic targets.

Free Research Field

消化器外科学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究において、胃癌PDXにおける細胞表面タンパク質の発現プロファイルから機能的サーフェスオームデータ基盤を構築し、その分子生物学的理解を深めることで、既存研究では俯瞰しえなかった革新的細胞表面タンパク質治療標的群を大規模に開拓できる。腫瘍特異性が高い細胞表面分子が同定されれば、抗体薬物複合体や癌抗原ワクチン、CAR-T療法など、免疫療法の革新につながることが期待される。また、胃癌特異的に発現する分子は、治療標的としてだけでなく、診断、再発・治療効果予測に有用な組織・血液バイオマーカーとしての展開が期待できる。