Development of diagnostic biomarker of malignant pleural mesothelioma using serum exosome

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K08903
• Research Institution: Hiroshima University
• Principal Investigator: 津谷 康大 広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 助教 (10534985)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 悪性胸膜中皮腫 / マイクロRNA / エクソソーム / バイオマーカー

Outline of Annual Research Achievements

悪性胸膜中皮腫に特異的なsmall RNA発現パターンの特定：新規バイオマーカー開発のために2022年3月までに悪性胸膜中皮腫患者43名、健常人34名、肺癌患者53名の治療前血清を用いてsmall RNAを精製した。悪性胸膜中皮腫患者43名と健常人34名small RNAの次世代シークエンサーにより発現パターンを網羅的に解析した。解析した77サンプルのうち20サンプルはannotated read数が少ないことが確認された。このため、両群の比較は全サンプル77例での解析、annotated read数が保たれている57例の2グループでそれぞれ解析を行い、両グループで共通する両群で有意な差を認める26のsmall RNAを同定した。この解析では既知のmicro RNAのみならず、未知のマイクロRNAやtransfer RNAの断片、成熟マイクロRNA（miR）など以外に1塩基の付加や欠失を認めるisomiRも同定可能であリ、実際に解析結果に含まれている。
今後は健常人サンプル13例、肺癌患者53サンプルを追加解析し、悪性胸膜中皮腫に特異的に発現（低発現）するsmall RNAの同定を更に進める予定である。特異的発現パターンは特定のsmall RNAのみならず、複数のsmall RNAの組み合わせパターンであることも想定されるため、その解析には人工知能（AI）を用いる予定である。また次世代シークエンサーで同定されたsmall RNAの発現はRT-PCR法でも確認する予定である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

患者の血清サンプルからsmall RNAのライブラリー作成、次世代シークエンスまでの流れが順調であり、これまでに77サンプルで次世代シークエンスの結果が得られたことは予定通りである。

Strategy for Future Research Activity

今後は健常人サンプル13例、肺癌患者53サンプルを追加解析し、悪性胸膜中皮腫に特異的に発現（低発現）するsmall RNAの同定を更に進める予定である。特異的発現パターンは特定のsmall RNAのみならず、複数のsmall RNAの組み合わせパターンであることも想定されるため、その解析には人工知能（AI）を用いる予定である。また次世代シークエンサーで同定されたsmall RNAの発現はRT-PCR法でも確認する予定である。

Causes of Carryover

実験消耗品の購入において、COVID-19の影響で納期が遅れたものが存在したため、物品費を次年度に繰越し、納入可能となり次第、購入、実験に使用する予定である。