Development of diagnostic biomarker of malignant pleural mesothelioma using serum exosome

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K08903
• Research Institution: Kindai University
• Principal Investigator: 津谷 康大 近畿大学, 医学部, 教授 (10534985)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2025-03-31
• Keywords: 悪性胸膜中皮腫 / マイクロRNA / エクソソーム / バイオマーカー

Outline of Annual Research Achievements

新規バイオマーカー開発のために悪性胸膜中皮腫患者53名、健常人47名、肺癌患者43名の治療前血清を用いてsmall RNAを精製した。悪性胸膜中皮腫患者と健常人の患者背景を可能な限り揃えるため、健常人サンプルの選択には年齢、性別を加味し調整を行なった。悪性胸膜中皮腫の組織型は上皮型35検体、肉腫型10検体、二相型7検体であった。
精製したsmallRNAについてクオリティチェックを行なった後に、悪性胸膜中皮腫患者53名と健常人47名small RNAの次世代シークエンサーによるシークエンスを施行した。
Learning setにおいて悪性胸膜中皮腫35例と健常人32例のサンプルで比較を行った。悪性胸膜中皮腫で有意に上昇するsmall RNAを3種同定した。健常人で有意に上昇するsmall RNAは基本的に赤血球由来の非特異的な遺伝子がであった。
上記で同定された3種のsmall RNAを用いdiagnostic model indexを作成し、AUC = 0.74286、sensitivityを優先したカットオフ値0.9022にてaccuracy 62.69%, sensitivity 91.43%, specificity 31.25%との結果を得た。悪性胸膜中皮腫18例、健常人15例を用いたValidation setにおいて上記カットオフ値にてaccuracy 63.64%, sensitivity 94.44%, specificity 26.67%との結果であり、diagnostic model indexは有用であると考えられた。
また、diagnostic model indexにおいては健常人と肺癌患者の間に有意差と認めず、悪性胸膜中皮腫の診断に特異的なindexであると考えられた。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

患者の血清サンプルからsmall RNAのライブラリー作成、次世代シークエンスまでの流れが順調であり、これまでに100サンプルで次世代シークエンスの結果が得られたことは予定通りである。
またこれらのシークエンス結果を解析し、悪性胸膜中皮腫において特異的に発現するsmall RNAを3種同定し、diagnostic model indexを作成し、その結果はvalidation setで確認された。現在論文作成中であり、おおむね順調に進展していると判断される。

Strategy for Future Research Activity

悪性胸膜中皮腫の新規診断バイオマーカー(diagnostic model index)を同定し、単施設の結果ではあるが、dalidation setにおいてもその有用性が確認され、現在論文作成中である。
今後はこのdiagnostic model indexの有用性を多施設共同研究で確認する必要があると考えている。

Causes of Carryover

予定された実験は概ね終了しているが、論文作成、投稿や学会発表に関する準備を要するために次年度使用額が生じた。これらの成果発表のために研究費を使用する予定である。