2021 Fiscal Year Research-status Report
The study of transcriptional regulation of functional RNAs involved in drug resistance in head and neck cancer
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21K09577
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
関 直彦 千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (50345013)
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2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | スーパーエンハンサー / 機能性RNA / マイクロRNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
頭頸部・口腔扁平上皮癌（SCC）に日常診療において、初診時に既に進行症例である患者にしばしば遭遇する。外科的な手術が適応されない患者に対しては、薬物療法・放射線治療が施される。しかしながら治療過程で癌細胞は治療抵抗性を獲得する。治療抵抗性を獲得した癌細胞に対する効果的な治療法は無く、その様な患者の生命予後は極めて厳しい。
頭頸部・口腔扁平上皮癌（SCC）を含む癌の臨床上の課題は、治療抵抗性を獲得した癌細胞に対して、治療抵抗を解除する新規治療法の開発である。そのためには、癌細胞が様々な治療に対して、治療抵抗性を獲得する分子機序の更なる解明は不可欠である。
近年、細胞の運命を決定する極めて重要な場面において、ゲノム上で「スーパーエンハンサー：SE」と定義される強力な転写制御領域が形成され、細胞の運命を決定する機能性分子を発現誘導するという概念が提唱された。この概念を治療抵抗癌細胞に適応させると、癌細胞が抗癌剤などの薬剤に暴露された際に、癌細胞は自らの生存を賭けて、SEを形成し、薬剤耐性に関与する機能性分子を強力に発現すると考える。
口腔癌細胞株に、分子標的薬であるセツキシマブを暴露した細胞を用いて、免疫沈降法（Chromatin immunoprecipitation: ChIP）と次世代シークエンサーを組み合わせたChIP-sequenceを行い、ゲノム上のSEの検出を行った。ChIPに用いる抗体として、H3K27ACを使用した。その結果、セツキシマブを長期間暴露した細胞に特徴的なSEを検出した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
口腔扁平上皮癌細胞株（SAS細胞およびHSC3細胞）に、分子標的薬であるセツキシマブを暴露させた後、H3K27AC抗体を用いて、免疫沈降法（Chromatin immunoprecipitation: ChIP）と次世代シークエンサーを組み合わせたChIP-sequenceを行い、ゲノム上のSEの検出に成功した。
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| Strategy for Future Research Activity |
口腔扁平上皮癌細胞株（SAS細胞およびHSC3細胞）に、抗癌剤（CDDP)を暴露させた後、H3K27AC抗体またはBRD4抗体を用いて、免疫沈降法（Chromatin immunoprecipitation: ChIP）と次世代シークエンサーを組み合わせたChIP-sequenceを行い、ゲノム上のSEの検出を行う。
検出されたSE領域に存在する機能性RNA分子（蛋白コード遺伝子、蛋白非コード遺伝子およびマイクロRNA）を同定し、口腔癌患者の臨床病理に影響を与えている機能性RNA分子の探索を行う。
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| Causes of Carryover |
実験に使用する試薬等のストックがあり、節約が可能であったため。
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