2021 Fiscal Year Research-status Report
Targeted exome analysis as a diagnostic tool for the leptin-melanocortin pathway related genes in childhood obesity
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21K11701
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
中島 久和 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任講師 (80363985)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 潤 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20750011)
森元 英周 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20827539)
福原 正太 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任助教 (80817685)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 小児肥満 / レプチン-メラノコルチン摂食抑制系 / 次世代シーケンサ / ゲノム解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
小児肥満（症）の患者を対象に次世代シーケンサを用いた単一遺伝子病としてのゲノム解析を計画した。
京都府立医科大学病院小児科、京都府立医科大学附属北部医療センター、およびその研究協力機関に通院する小児肥満症患者を対象とした。なお、小児期に発症した成人肥満（症）の患者も対象とする。末梢血白血球よりゲノムDNAを抽出し、次世代シーケンサにてレプチン遺伝子、レプチン受容体遺伝子、MC4R遺伝子、POMC遺伝子、などのレプチン-メラノコルチン系の摂食調節に関わる遺伝子を解析する。それらの遺伝子のバリアントによる単一遺伝子の質的異常が発見される頻度を調査する。解析の対象として遺伝子は本研究はヒトゲノム研究の範疇に中るため、政府が発行した「ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理指針」に従い、研究計画書およびインフォームドコンセント用の説明書などを作成した。まだ単一遺伝子の病的バリアントに由来する肥満症患者を検出することにはなっていないが、染色体分析の結果、染色体異常に由来する肥満症と考えれた症例を経験した。47, XXY, t(4;5)(q21.2;q32)の結果であり、クラインフェルター症候群と診断が可能であったが、染色体転座部位に関してエクソーム解析およびアレイCGHによるさらなる解析を進める予定である。次世代シーケンサにくわえ、染色体分析やアレイCGHなどの技術におるゲノム解析も必要と考えられる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
本研究はヒトゲノム研究の範疇に中るため、政府が発行した「ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する
倫理指針」に従い、研究計画書およびインフォームドコンセント用の説明書などを作成した。ゲノム研究の研究計画書京都府立医科大学医学研究倫理審査委員会にて研究計画書を審査中である。６名の審査委員による小委員会で、何度かの研究計画の修正・改善を求められている。その結果、本審査にまで進んでいないため、研究許可が下されていない。よって、研究計画の本格的な実施に至っていない。
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| Strategy for Future Research Activity |
京都府立医科大学研究倫理審査委員会の審査にて研究開始許可が発出されれば、小児肥満症の患者およびその保護者からインフォームドコンセントを取得し、研究対象者のエントリーを進めていく予定である。次世代シーケンサによるエクソーム解析によって、関心領域の遺伝子群について解析を進める。とくに、レプチン遺伝子(LEP)、レプチン受容体遺伝子(LEPR)、MC4R、POMC、PCSK1の遺伝子群に注目して解析を進める。また、われわれの既存の診療における範疇で、小児肥満症に染色体異常が含まれることが判明した。染色体分析（Gバンディング）やアレイCGHの技術も加えて検討する予定である。
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| Causes of Carryover |
次世代シーケンスを持ちいたゲノム解析を予定をしているため、そのためのゲノム解析費用を計上している。本研究に関して研究計画書を作成し、京都府立医科大学医学研究倫理委員会の審査を行なっている。何度かの査読・改善を繰り返しているため、審査期間が長引いている。このような経過を辿っているため、次世代シーケンサを用いたゲノム解析の研究範囲に関しては研究許可が下されていない。研究許可が発出されたあとは、研究協力者をエントリーし、解析数を増やしていく予定である。解析数が今後見込まれるため、次年度に予算を使用して研究を進める予定である。
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