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2023 Fiscal Year Annual Research Report

肺がん分子標的薬の選択を可能にする分子シミュレーションと数理モデルの解析系の確立

Research Project

Project/Area Number 21K12110
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

高岡 裕  富山大学, 学術研究部医学系, 教授 (20332281)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 菅野 亜紀  富山大学, 学術研究部医学系, 特命助教 (20457039)
永野 達也  神戸大学, 医学研究科, 講師 (80624684)
大田 美香  富山大学, 学術研究部医学系, 特命助教 (20274706)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsEGFR-TKI / EGFRチロシンキナーゼ阻害剤 / 分子標的薬 / 分子シミュレーション
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、肺がん分子標的薬であるEGFRチロシンキナーゼ阻害剤(EGFR-TKI)と各変異型EGFRとの薬物相互作用を、チロシンキナーゼ活性を競合阻害するモデルとして分子シミュレーション解析(モデリングとMD計算による変異型の立体構造解析およびEGFR-TKIとのドッキング解析)により解析した。その研究目的は、この分子標的薬の薬効予測法を確立することである。これまでの研究から、分子標的薬の結合親和性が薬効に関連することは示唆されてきた。しかし研究を進める中で、分子シミュレーション解析結果と薬効が合わないケースが散見された。これは、本研究の目的である変異型EGFRごとの最適な肺がん分子標的薬の選択指標を提供可能にする方法論の確立の、障害である。 そこで最終年度は、前年度に見出した「知られている変異部位以外にもアミノ酸置換が存在する」という仮説について検証を進めた。具体的には、、第一世代薬のエルロチニブにおいて、L858R変異またはA871G変異ではいずれもエルロチニブは有効だが、L858RとA871Gの複数変異を生じている患者では効かないという報告を見出した。これらについて、EGFR二量体の各単独変異と複数変異について、(1)変異ホモ、(2) レシーバーが変異型のヘテロ、(3)アクティベータが変異型のヘテロの計3分子、計9分子の立体構造を解析し、エルロチニブでドッキング解析した。前年度までに(1)、(2)を完了させ、最終年度は(3)を完了させて、in vivoの結果を分子シミュレーションで再現できた。以上の結果から、分子標的薬のEGFR- TKIの治療に際して治療薬について、例えば1、2、3の世代別に分けて、第1世代のゲフィチニ ブ、エルロチニブ、アファチニブ(第2世代)、オシメルチニブ(第3世代)の中から選択する場合、変異によっては一部分だけの遺伝子検査では不十分であり、シーケンス解析が望まれるということを示唆している。

  • Research Products

    (13 results)

All 2023 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results)

  • [Int'l Joint Research] Queen Mary University of London(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Queen Mary University of London
  • [Journal Article] Somatic mutations of CADM1 in aldosterone-producing adenomas and gap junction-dependent regulation of aldosterone production2023

    • Author(s)
      Wu Xilin、Azizan Elena A. B.、Goodchild Emily、Garg Sumedha、Hagiyama Man、(略)、Satoh Fumitoshi、Oki Kenji、(略)、Takaoka Yutaka、Murray Sandra A.、Zennaro Maria-Christina、Beuschlein Felix、Ito Akihiko、Brown Morris J.
    • Journal Title

      Nature Genetics

      Volume: 55 Pages: 1009~1021

    • DOI

      10.1038/s41588-023-01403-0

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Prediction of visceral pleural invasion of clinical stage I lung adenocarcinoma using thoracoscopic images and deep learning2023

    • Author(s)
      Shimada Yoshifumi、Ojima Toshihiro、Takaoka Yutaka、Sugano Aki、Someya Yoshiaki、Hirabayashi Kenichi、Homma Takahiro、Kitamura Naoya、Akemoto Yushi、Tanabe Keitaro、Sato Fumitaka、Yoshimura Naoki、Tsuchiya Tomoshi
    • Journal Title

      Surgery Today

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1007/s00595-023-02756-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In silico binding affinity of the spike protein with ACE2 and the relative evolutionary distance of S gene may be potential factors rapidly obtained for the initial risk of SARS-CoV-22023

    • Author(s)
      Sugano Aki、Murakami Junon、Kataguchi Haruyuki、Ohta Mika、Someya Yoshiaki、Kimura Shigemi、Kanno Akira、Maniwa Yoshimasa、Tabata Toshihide、Tobe Kazuyuki、Takaoka Yutaka
    • Journal Title

      Microbial Risk Analysis

      Volume: 25 Pages: 100278~100278

    • DOI

      10.1016/j.mran.2023.100278

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Potential Contribution of Cell Adhesion Molecule 1 to the Binding of SARS-CoV-2 Spike Protein to Mouse Nasal Mucosa2023

    • Author(s)
      Takeuchi Fuka、Sugano Aki、Yoneshige Azusa、Hagiyama Man、Inoue Takao、Wada Akihiro、Takaoka Yutaka、Ito Akihiko
    • Journal Title

      Cells Tissues Organs

      Volume: - Pages: 1~12

    • DOI

      10.1159/000534892

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 仮説検証から予測確認へのパラダイムシフト: in silico解析のヘルスケアへの展開2023

    • Author(s)
      高岡 裕
    • Organizer
      第43回和漢医薬学総合研究所特別セミナー 『富山大学―熊本大学連携による持続可能なグローバルヘルスケア研究拠点の形成』
    • Invited
  • [Presentation] 病態の分子シミュレーション解析系確立と計算創薬教育基盤の整備2023

    • Author(s)
      高岡 裕
    • Organizer
      Toyama Academic GALA 2023
    • Invited
  • [Presentation] 検証から予測へ:分子シミュレーションと数理モデルによる漢方薬の薬物有害反応解析2023

    • Author(s)
      高岡 裕
    • Organizer
      第13回 日本中医薬学会シンポジウム「伝統医学を科学する」
    • Invited
  • [Presentation] Prediction research for the bio process by the homology modeling and molecular dynamics simulation - from Verification to Prediction2023

    • Author(s)
      Yutaka TAKAOKA
    • Organizer
      MOE Symposium 2023
    • Invited
  • [Presentation] Prediction for Adverse Reaction and Efficacy of Medicine by Molecular Dynamics Simulation - from Verification to Prediction -2023

    • Author(s)
      Yutaka TAKAOKA
    • Organizer
      The 7th Toyama-Basel Joint Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 分子シミュレーション解析による腸間膜静脈硬化症の病因予測2023

    • Author(s)
      大田美香、菅野亜紀、高岡 裕
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 構造解析と多変量解析を用いたWT1遺伝子exon 8-9ミスセンス変異における臨床症状予測2023

    • Author(s)
      染谷芳明、長野智那、大田美香、菅野亜紀、野津寛大、高岡 裕
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] SARS-Cov-2スパイクタンパクのACE2 in silico結合能とS遺伝子進化距離による感染リスクの予測2023

    • Author(s)
      菅野亜紀、村上純音、片口治幸、大田美香、木村重美、高岡 裕
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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