2022 Fiscal Year Research-status Report
Isolation of rare actinomycetes for screening of new compound from deep-sea water
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21K14794
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Research Institution | Toyama Prefectural University |
Principal Investigator |
春成 円十朗 富山県立大学, 工学部, 講師 (00750449)
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Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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Keywords | 海洋深層水 / 放線菌 / Rhodococcus / Streptosporangium |
Outline of Annual Research Achievements |
昨年度と同様に、新型コロナ感染症の影響により、申請当初に計画をしていた全国の海洋深層水取水施設へのサンプリングが困難な状況であった。また、今後も計画通りに遂行できない可能性が考えられた。そのため、当初予定していた研究計画を大きく変更し、製品評価基盤機構(NITE)の微生物保存機関であるバイオテクノロジーセンター(NBRC)で提供されているスクリーニング用微生物(RD株)から、海洋深層水由来の放線菌株を検索した。このうち、特に研究報告例の無い北海道羅臼の海洋深層水から分離された55株について、詳細な生産物の解析を実施することで、新規化合物の探索を行うこととした。 はじめに、前年度に新規化合物が得られ、海洋深層水に存在する放線菌における有用希少放線菌として選定したRhodococcus属から6株、さらには海洋深層水からの分離例が極めて少ない、Streptosporangium属20株を優先的に研究に用いた。これら26株は3種類の化合物生産用培地にて培養・抽出し、主にHPLCを用いた生産物の詳細な解析を行った。解析の結果、大半の株では生産物の量が検出限界であったり、構造解析が困難であると判断された。構造解析に十分な量の化合物を生産していると判断したRhodococcus属の1株、Streptosporangium属の2株について、追加で生産培養を行い、目的化合物を各種クロマトグラフィーにて精製した。NMR、MSスペクトルによる構造解析の結果、Rhodococcus株から1つ、Streptosporangium属から2つの新規化合物を得た。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画からは大きく変更となったが、新規化合物を得ることに成功している。このうちRhodococcusから得られた化合物の構造は、SciFinderで検索しても類似する構造の登録がないことから、天然物としてはもちろん、有機化合物として新規性が極めて高い化合物であるといえる。
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Strategy for Future Research Activity |
得られた新規化合物の平面構造に間違いが無いことを確実にして、次に立体化学を明らかにする。立体化学の決定には収量が少ないことから、はじめに非破壊的な比旋光度とECDスペクトルによる決定を試みる。次に計算化学によるECDの算出、結晶化によるX線回析、有機合成的手法を検討する。加えて、新規性の高いRhodococcus由来の化合物は生合成経路にも興味が持たれるため、炭素の同位体標識実験により解析を行う。
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Causes of Carryover |
機器購入におけるわずかな差額であり、使用計画に変更は生じない。
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