2022 Fiscal Year Research-status Report
ゲノミクス系統地理情報を基にした淡水魚類の保全戦略マップの作成
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21K14869
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| Research Institution | Lake Biwa Museum |
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Principal Investigator |
田畑 諒一 滋賀県立琵琶湖博物館, 研究部, 学芸員 (00793308)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 淡水魚 / MIG-seq / mtDNA / 系統地理 / 遺伝的集団構造 / 日本 / 東アジア |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、ゲノムワイドな核DNA情報を用いて、日本を中心とした東アジア地域の淡水魚類の多数種を対象にした遺伝的集団構造の把握と保全戦略の策定を検討する。種内における遺伝的に固有な地域集団（遺伝的集団）を把握することは、生物多様性の保全や生物資源の管理には必要不可欠である。申請者はこれまでミトコンドリアDNA （mtDNA）を用いた琵琶湖産魚類を中心とした淡水魚の系統解析や遺伝的集団構造把握、進化生物学的研究を行い、その中で比較のために用いた核ゲノム解析から複数の種における核ゲノムとmtDNAによる遺伝的集団構造での不一致を見出してきた。これまで多くの生物でmtDNAによる分析が行われてきた。そのため、現在、各地で行われている生息域外保全、系統保存がそのデータに基づいており、申請者が見出してきたmtDNAと核ゲノムの不一致から考えれば、地域集団の、ひいては種の絶滅を防ぐためには、核ゲノムデータを用いた真の遺伝的集団構造も加味した保全戦略を策定することが緊急の課題となっている。
本年度は、昨年度実施した種の補完的な実験に加えて、新たに複数の種類についてMIG-seq法を用いた系統地理解析および集団遺伝分析を行った。その中には水族館等で継代飼育している個体群の素性が本当に正しいのか、また今後個体群の入れ替えを行う際に元の個体群がきちんと管理されていた個体群（交雑個体が入っていない個体群）かを確かめたものもある。一部種群では、解析が概ね終了したため、順次成果公表に向けての準備に入っている。また、イワナについては、国際学術誌に論文が公表された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
本年度も順次実験を進めてきたが、新型コロナウイルス感染症の保健所応援に派遣されたり、所属の博物館の水族展示室の大型水槽破損事故が起き、その対応にあたっている等、当初計画の目標よりも実験種数が少なくなっている。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続き分析予定の種群について、分析を進めていく。分析に着手していない種についても、分析試料やDNA試料は概ね揃っているものが多いため、分析に着手していく時間さえ確保できれば、挽回は可能と思われる。また実験補助員の確保により、実験を進めていく。
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| Causes of Carryover |
新型コロナウイルス感染症による移動制限のため、旅費の使用がほとんどなかった。また、コロナウイルス対策のため保健所への応援業務に派遣されたり、所属の博物館の水族展示室の大型水槽破損対応の陣頭指揮に当たっていたため、研究計画が予定通り進まなかった。さらに、分析の委託回数をできるだけまとめるため、次年度に計画を先送りした。次年度は順次分析委託するため、サンプル準備のための消耗品購入、委託費が増えると予想される。また、実験補助員に実験や解析の依頼をするため、人件費・謝金も増加する。
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