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2022 Fiscal Year Research-status Report

フナ類におけるクローン繁殖の分子基盤の解明からその応用まで

Research Project

Project/Area Number 21K14919
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

三品 達平  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 基礎科学特別研究員 (40830162)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsフナ / クローン繁殖 / 遺伝基盤 / 減数分裂 / 受精卵
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、クローン繁殖の責任候補遺伝子が絞り込まれているコイ科フナ属魚類をモデルとして、減数分裂における染色体分配の制御機構および、受精後の核構造の制御機構の理解、その応用によるクローン繁殖動物の作出を目指すことである。二年目である2022年度は、主に(1)クローン繁殖をするフナ類のゲノム組成の解明(2)進化ゲノム解析によって同定されたクローン繁殖の責任候補遺伝子(変異)による表現型の再現実験 を実施した。
(1)クローン繁殖をするフナのゲノム組成の詳細について全ゲノム解読データを用いて解析した。その結果、有性生殖をするフナからの遺伝子浸透によってゲノムが組換えを伴いながらダイナミックに置き換わってきたことが示された。また、同定された責任候補遺伝子の多くでコピー数の増加が示唆された。
(2)進化ゲノム解析によって同定されたクローン繁殖の責任候補遺伝子(変異)のうち、組換えの欠如に関与すると考えられる候補遺伝子を欠損させたゼブラフィッシュにおいて、クローン繁殖をするフナと同様の形質が見られるかを検討した。その結果、候補遺伝子を欠損したゼブラフィッシュでは組換えの欠失が認められるものの卵母細胞は成熟し、部分的に表現型を再現できた。しかしながら、極体放出が起こるなどフナの表現型とは異なる部分が認められるため、複数の分子機構について同時に遺伝子操作をする実験を進めている。
また、本研究課題の関連研究である、クローン繁殖をするフナがキンギョと交雑することで緋色のクローン繁殖をするフナが生じることを報告する論文を出版した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

前年度の第一極体放出の抑制に加え、2022年度は組換えの欠如についても候補遺伝子の遺伝子操作実験によってフナ属魚類でみられるクローン繁殖の表現型をゼブラフィッシュにおいて部分的に再現することに成功した。また、クローン繁殖をするフナのゲノム組成の詳細が明らかになり、組換えを伴う遺伝子浸透パターンが可視化されたことで、その進化史が鮮明になった。
これらの進展に加え、クローン繁殖をするフナがキンギョと交雑することで緋色のクローン繁殖をするフナが生じることを報告する論文を出版できた。以上のように、おおむね順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

2022年度の研究結果によって、フナ類におけるクローン繁殖の分子基盤は、複数の細胞学的パスウェイの変化が同時に起こることが重要であると示唆された。そこで、分子基盤に関する証拠をより強固なものとするために(1)ゼブラフィッシュを対象に複数パスウェイの遺伝子操作実験を同時に遂行する。また、(2)クローン繁殖をするフナにおいて責任候補変異をもつアリルをノックダウンした際に有性型の形質に戻るかを調べる。また、これまで成果をまとめて論文としてまとめる。

  • Research Products

    (6 results)

All 2023 2022 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The detailed population genetic structure of the rare endangered latid fish akame Lates japonicus with extremely low genetic diversity revealed from single-nucleotide polymorphisms2023

    • Author(s)
      Naito Takuya、Nakayama Kouji、Takeshima Hirohiko、Hashiguchi Yasuyuki、Akita Tetsuya、Yamasaki Yo Y.、Mishina Tappei、Takeshita Naohiko、Nagano Atsushi J.、Takahashi Hiroshi
    • Journal Title

      Conservation Genetics

      Volume: 24 Pages: 523~535

    • DOI

      10.1007/s10592-023-01517-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Origin of scarlet gynogenetic triploid Carassius fish: Implications for conservation of the sexual-gynogenetic complex2022

    • Author(s)
      Mishina Tappei、Nomoto Kazuhiro、Machida Yoshiyasu、Hariu Tsutomu、Watanabe Katsutoshi
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0276390

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0276390

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 2022年度魚類学会年会シンポジウム「ゲノムが拓く魚類表現型多様性研究の新展開:分野横断的自然史研究と今後の展望」を開催して2022

    • Author(s)
      三品達平・山﨑曜
    • Journal Title

      魚類学雑誌

      Volume: 69 Pages: 252~257

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] フナ属魚類における雌性発生の遺伝基盤から見えた性の進化的制約2022

    • Author(s)
      三品達平
    • Organizer
      日本魚類学会
  • [Presentation] フナ属魚類におけるクローン繁殖の遺伝基盤から見えた性の進化的制約2022

    • Author(s)
      三品達平
    • Organizer
      有性生殖研究会
  • [Remarks] 天然記念物ヒブナの起源を解明―クローン繁殖のはずなのにキンギョと交雑―

    • URL

      https://www.kyoto-u.ac.jp/ja/research-news/2022-10-21

URL: 

Published: 2023-12-25  

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