Prevalence of antimicrobial resistance genes among non-pathogenic bacteria population in the gut-microbiota

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K14994
• Research Institution: Okayama University of Science
• Principal Investigator: 太田 奈保美 岡山理科大学, 獣医学部, 助教 (50847390)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 腸内細菌 / 耐性菌

Outline of Annual Research Achievements

本研究はこれまであまり着目されてこなかった牛の腸内細菌に含まれる非病原性細菌における耐性菌の種類や量を明らかにし、これらの細菌が抗生物質の投与によって受ける影響を解明する。また、病原細菌が薬剤耐性菌へと変化する過程において、非病原性の常在腸内細菌から耐性遺伝子を受け取る可能性について検討する。抗生物質の適正使用が謳われる中で、テトラサイクリン耐性の病原性細菌は依然として多くの家畜で検出されている。テトラサイクリン耐性遺伝子（tet）は数十種類あり、プラスミドやトランスポゾン等を介して容易に細菌間伝達されるため、広範な宿主域を持つ。
本年度は使用する糞便サンプルの採集と既に採集済みの一部のサンプルを用いて、本試験の前実験に使用するサンプルの検討を行った。前実験に使用するサンプルの条件として、ターゲットとしているテトラサイクリン耐性遺伝子を持つ細菌を含む糞便の探索を行なった。また、実験の諸段階の条件検討を進めた。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

サンプルの採集の条件に当てはまる牛および十分なサンプルの確保ができていないため。

Strategy for Future Research Activity

引き続き実験手法の検討とサンプルの採集を継続し、常在非病原性細菌における耐性菌の探索を行う。

Causes of Carryover

次世代シーケンサーによるゲノム解析の実施まで至っていないため、関連試薬等の購入を行わなかったことから、次年度に繰り越すこととなった。