Mechanism of target nucleosome recognition by the pioneer transcription factor FoxA1

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K15014
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 43010:Molecular biology-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: Tanaka Hiroki 東京大学, 定量生命科学研究所, 特任研究員 (90880104)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: クロマチン / ヌクレオソーム / 転写因子

Outline of Final Research Achievements

In this study, to understand the mechanism how the pioneer transcription factor FoxA1 binds to its target nucleosome, we reconstituted the target nucleosome in vitro, and performed biochemical and structural analyses. We tried to purify FoxA1-nucleosome complex and prepare samples for cryo-EM analysis.

Free Research Field

生化学、構造生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

パイオニア転写因子がどのようにヌクレオソームに作用するかを明らかにすることは、細胞の分化や初期化の分子メカニズムを理解する上で重要な意味がある。本研究で、クライオ電子顕微鏡構造解析に向けてFoxA1-ヌクレオソーム複合体の大量調製系を確立した。この系は、他のパイオニア転写因子とヌクレオソームの複合体を調製する上でも有効な手段となる。