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2022 Fiscal Year Annual Research Report

翻訳開始因子eIF4A1とグルタミン代謝による協調的な発現制御機構

Research Project

Project/Area Number 21K15023
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

七野 悠一  国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 研究員 (40748365)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Keywords翻訳 / 代謝 / 翻訳開始 / グルタミン / 次世代シーケンサー
Outline of Annual Research Achievements

細胞は外界の変化に応じ、翻訳と代謝をダイナミックに制御する。両者の協調的な制御は環境変化に適応するために必須であると考えられているが、その機構には不明な点が多い。前年度までに、翻訳開始因子eIF4A1のノックアウト細胞をグルタミンが不安定な条件で培養するとその増殖が顕著に低下する、という現象を見出し、その原因の候補遺伝子としてODC1を同定していた。ODC1はポリアミン合成の律速段階を担う酵素の遺伝子であり、実際、メタボローム解析からeIF4A1ノックアウトとグルタミン飢餓によってポリアミン量が低下することがわかった。そこで、野生型の細胞を候補遺伝子の特異的阻害剤で処理したところ、グルタミンが不安定な条件における生育が低下し、候補遺伝子がグルタミン依存性の原因であることが示唆された。また、ODC1の5’側非翻訳領域(5’ UTR)を結合させたレポーター遺伝子を作成し、様々に変異を導入することで翻訳制御に重要な配列モチーフを探索したところ、二次構造とupstream open reading frame(uORF)の両方が翻訳に対して抑制的に働いていることがわかった。
並行してeIF4A1とアミノ酸全般の飢餓との関連についても解析を進めた。生育環境からアミノ酸が枯渇すると特定のmRNAの翻訳が著しく低下することが知られている。しかし、eIF4A1ノックアウト細胞では翻訳低下しにくくなっていることを発見した。また、アミノ酸飢餓時の生育低下についても抑圧されていた。すなわち、前述の表現型はグルタミン特異的なものであることが示唆された。

  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 6 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of California, Berkeley(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of California, Berkeley
  • [Journal Article] ILF3 prion-like domain regulates gene expression and fear memory under chronic stress2023

    • Author(s)
      Yamashita Akira、Shichino Yuichi、Fujii Kazuki、Koshidaka Yumie、Adachi Mayumi、Sasagawa Eri、Mito Mari、Nakagawa Shinichi、Iwasaki Shintaro、Takao Keizo、Shiina Nobuyuki
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26 Pages: 106229~106229

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.106229

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Minimal upstream open reading frame of Per2 mediates phase fitness of the circadian clock to day/night physiological body temperature rhythm2023

    • Author(s)
      Miyake Takahito、Inoue Yuichi、Shao Xinyan、Seta Takehito、Aoki Yuto、Nguyen Pham Khanh Tien、Shichino Yuichi、Sasaki Junko、Sasaki Takehiko、Ikawa Masahito、Yamaguchi Yoshiaki、Okamura Hitoshi、Iwasaki Shintaro、Doi Masao
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Pages: 112157~112157

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112157

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A parasitic fungus employs mutated eIF4A to survive on rocaglate-synthesizing Aglaia plants2023

    • Author(s)
      Chen Mingming、Kumakura Naoyoshi、Saito Hironori、Muller Ryan、Nishimoto Madoka、Mito Mari、Gan Pamela、Ingolia Nicholas T、Shirasu Ken、Ito Takuhiro、Shichino Yuichi、Iwasaki Shintaro
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 12 Pages: e81302

    • DOI

      10.7554/eLife.81302

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Thor-Ribo-Seq: ribosome profiling tailored for low input with RNA-dependent RNA amplification2023

    • Author(s)
      Mito Mari、Shichino Yuichi、Iwasaki Shintaro
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1101/2023.01.15.524129

    • Open Access
  • [Journal Article] Gravitational and mechanical forces drive mitochondrial translation through the cell adhesion?FAK axis2023

    • Author(s)
      Wakigawa Taisei、Kimura Yusuke、Mito Mari、Tsubaki Toshiya、Saito Hironori、Khan Abdul Haseeb、Yamamori Tohru、Yamazaki Tomokazu、Higashibata Akira、Tsuboi Tatsuhisa、Saito Taku、Higashitani Atsushi、Shichino Yuichi、Iwasaki Shintaro
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1101/2023.01.18.524628

    • Open Access
  • [Journal Article] Multifarious Translational Regulation during Replicative Aging in Yeast2022

    • Author(s)
      Zhao Tianyu、Chida Asaka、Shichino Yuichi、Choi Dongwoo、Mizunuma Masaki、Iwasaki Shintaro、Ohya Yoshikazu
    • Journal Title

      Journal of Fungi

      Volume: 8 Pages: 938~938

    • DOI

      10.3390/jof8090938

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Compounds for selective translational inhibition2022

    • Author(s)
      Shichino Yuichi、Iwasaki Shintaro
    • Journal Title

      Current Opinion in Chemical Biology

      Volume: 69 Pages: 102158~102158

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2022.102158

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Novel repressive role of eIF4A1 during mTORC1 inhibition2022

    • Author(s)
      Yuichi Shichino
    • Organizer
      第60回生物物理学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 翻訳開始因子eIF4A1はLARP1による翻訳抑制を促進する2022

    • Author(s)
      七野悠一,水戸麻理,柏木一宏,高橋真理,伊藤拓宏,Nicholas T. Ingolia,岩崎信太郎
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2022年大会
    • Invited
  • [Presentation] eIF4A1 facilitates LARP1-mediated translation repression during mTORC1 inhibition2022

    • Author(s)
      Yuichi Shichino,Mari Mito,Kazuhiro Kashiwagi,Mari Takahashi,Takuhiro Ito,Nicholas T. Ingolia,Shintaro Iwasaki
    • Organizer
      第22回日本RNA学会年会
  • [Remarks] プリオン様ドメインがストレス下でもマウスの不快記憶形成を可能にすることを発見

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2023/20230330_2/index.html

  • [Remarks] 翻訳阻害剤を介した、植物と糸状菌間の生存競争

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2023/20230228_2/

URL: 

Published: 2023-12-25  

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