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2021 Fiscal Year Research-status Report

ロドプシンの個性を生かした生命現象の革新的光操作法の開発

Research Project

Project/Area Number 21K15054
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

小島 慧一  岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (60819267)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2023-03-31
Keywords光生物学 / ロドプシン / 光操作 / オプトジェネティクス
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、多様なロドプシン分子の新奇的な性質を生かした革新的な光操作技術の開発を行う。すなわち、申請者らが解析してきた/見出したロドプシンの新奇的な性質を活用することで、動物細胞や個体における様々な生命応答を自在に光操作できる技術基盤を創成する。そのため、交付申請書に記載した実験計画に沿って、「分子特性の理解・改変と最適化」と「分子特性の動物細胞・個体への適用」を進めてきた。
「分子特性の理解・改変と最適化」に関しては、以下の(1)~(3)に成功した。(1)新規リン酸イオン輸送型ロドプシンの生化学的・分光学的解析を行い、イオン輸送モデルを提唱した。(2)深海生物由来のGPCR型ロドプシンの機能発現系を構築し、分子解析を行った。その結果、高いGq活性化能を持つ可視光吸収型分子の同定に成功した。(3)渦鞭毛藻由来のロドプシン(OmR2)の機能発現系を構築し、分光学的・生化学的・電気生理学的解析を行った。その結果、OmR2がプロトンポンプ機能を持つことを示し、そのイオン輸送機構を明らかにした。
「分子特性の動物細胞・個体への適用」に関しては、外向きプロトンポンプロドプシンであるAR3または内向きプロトンポンプロドプシンであるRmXeRを多様なヒト培養細胞(HeLa, SH-SY5Yなど)に発現させ、細胞内pHを自在に光で制御できる光操作技術を作出した。さらに、この手法を多様なヒト培養細胞および動物個体(線虫)へと適用し、細胞内のアルカリ化を介してアポトーシス(細胞死)を制御できる新規技術を開発した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

動物および微生物由来の多様なロドプシン分子の機能発現系の構築に成功しており、分光学的・生化学的・電気生理学的手法を活用することで、それら分子の作動原理の理解や新たな特性を持つ分子の同定を順調に進めている。
また、細胞内pHをロドプシンによって操作することで、アポトーシスを光制御するというこれまでにない新しいタイプの光操作技術を開発することができた。
以上のように、「分子特性の理解・改変と最適化」と「分子特性の動物細胞・個体への適用」において順調に成果・業績をあげていると考えている。

Strategy for Future Research Activity

今後も継続して、「分子特性の理解・改変と最適化」と「分子特性の動物細胞・個体への適用」を進めていきたい。
「分子特性の理解・改変と最適化」に関しては、以下に取り組む:(1)深海動物由来のロドプシンの作動原理の理解と改変を進めることで、既知分子よりも高いGタンパク質活性化能を持つ分子の同定・作出を目指す。(2)深海動物由来のロドプシンや申請者がこれまでに同定してきた高感度GPCR型ロドプシンに対して、Gタンパク質との相互作用部位にアミノ酸変異を加えることで、様々なGタンパク質(Gs,Go)を効率的に活性化する分子の作出を目指す。
「分子特性の動物細胞・個体への適用」に関しては、以下に取り組む:(1)リン酸イオン輸送型ロドプシンを大腸菌や動物細胞へと導入し、リン酸イオン濃度変化に伴う生命活動の光操作を実現する。(2)GPCR型ロドプシンを動物細胞(例:心筋細胞)へと導入し、Gタンパク質シグナリングを介した生命活動の光制御法を開発する。

  • Research Products

    (21 results)

All 2022 2021

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 3 results) Presentation (9 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Phototriggered Apoptotic Cell Death (PTA) Using the Light-Driven Outward Proton Pump Rhodopsin Archaerhodopsin-32022

    • Author(s)
      Nakao S, Kojima K, Sudo Y
    • Journal Title

      J Am Chem Soc

      Volume: 144 Pages: 3771-3775

    • DOI

      10.1021/jacs.1c12608

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An optogenetic assay method for electrogenic transporters using Escherichia coli co-expressing light-driven proton pump2021

    • Author(s)
      Hayashi M, Kojima K, Sudo Y, Yamashita A
    • Journal Title

      Protein Sci

      Volume: 30 Pages: 2161-2169

    • DOI

      10.1002/pro.4154

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional expression of the eukaryotic proton pump rhodopsin OmR2 in Escherichia coli and its photochemical characterization2021

    • Author(s)
      Kikuchi M, Kojima K, Nakao S, Yoshizawa S, Kawanishi S, Shibukawa A, Kikukawa T, Sudo Y
    • Journal Title

      Sci Rep

      Volume: 11 Pages: 14765.

    • DOI

      10.1038/s41598-021-94181-w

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Evolutionary adaptation of visual pigments in geckos for their photic environment2021

    • Author(s)
      Kojima K, Matsutani Y, Yanagawa M, Imamoto Y, Yamano Y, Wada A, Shichida Y, Yamashita T
    • Journal Title

      Sci Adv

      Volume: 7 Pages: eabj1316

    • DOI

      10.1126/sciadv.abj1316

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Biophysical and Biochemical Research of Animal Rhodopsins2021

    • Author(s)
      Kojima K
    • Journal Title

      Yakugaku Zasshi

      Volume: 141 Pages: 1155-1160

    • DOI

      10.1248/yakushi.21-00144

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microbial Rhodopsins as Multi-functional Photoreactive Membrane Proteins for Optogenetics2021

    • Author(s)
      Nakao S, Kojima K, Sudo Y
    • Journal Title

      Biol Pharm Bull

      Volume: 44 Pages: 1357-1363.

    • DOI

      10.1248/bpb.b21-00544

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Proton transfer pathway in anion channelrhodopsin-12021

    • Author(s)
      Tsujimura M, Kojima K, Kawanishi S, Sudo Y, Ishikita H
    • Journal Title

      Elife

      Volume: 10 Pages: e72264

    • DOI

      10.7554/eLife.72264

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression of microbial rhodopsins in Escherichia coli and their extraction and purification using styrene-maleic acid copolymers2021

    • Author(s)
      Kojima K, Sudo Y
    • Journal Title

      STAR Protoc

      Volume: 3 Pages: 101046

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2021.101046

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exploring the Retinal Binding Cavity of Archaerhodopsin-3 by Replacing the Retinal Chromophore With a Dimethyl Phenylated Derivative.2021

    • Author(s)
      Tsuneishi T, Takahashi M, Tsujimura M, Kojima K, Ishikita H, Takeuchi Y, Sudo Y
    • Journal Title

      Front Mol Biosci

      Volume: 8 Pages: 794948.

    • DOI

      10.3389/fmolb.2021.794948

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of an Outward Proton Pumping Rhodopsin with a New Record in Thermostability by Means of Amino Acid Mutations2021

    • Author(s)
      Yasuda S, Akiyama T, Kojima K, Ueta T, Hayashi T, Ogasawara S, Nagatoishi S, Tsumoto K, Kunishima N, Sudo Y, Kinoshita M, Murata T
    • Journal Title

      J Phys Chem B

      Volume: 126 Pages: 1004-1015.

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.1c08684

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] LED光源を用いたロドプシン蛍光観察システムの構築と膜電位の長時間イメージングへの展開2022

    • Author(s)
      小島慧一, 川西志歩, 渋川敦史, 坂本雅行, 須藤 雄気
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
  • [Presentation] 外向きプロトンポンプ型ロドプシンを用いた光アポトーシス誘導法の開発2022

    • Author(s)
      中尾新, 小島慧一, 須藤雄気
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
  • [Presentation] Archaerhodopsin-3 (AR3) における発色団レチナールのジメチルフェニル誘導体への置換と機 能・光化学的解析2021

    • Author(s)
      恒石泰地, 辻村真樹, 高橋雅崇, 小島慧一, 石北央, 竹内靖雄, 須藤雄気
    • Organizer
      日本生物物理学会 中国四国支部大会(第12回)
  • [Presentation] LED光源を用いたアーキロドプシン 3 由来の膜電位感受性蛍光の観察2021

    • Author(s)
      川西志歩, 小島慧一, 渋川敦史, 坂本雅行, 須藤雄気
    • Organizer
      日本生物物理学会 第12回中国四国支部大会
  • [Presentation] Optical control of apoptotic cell death with light-driven proton pump rhodopsins2021

    • Author(s)
      Nakao S, Kojima K, Sudo Y
    • Organizer
      日本生物物理学会 第12回中国四国支部大会
  • [Presentation] 光駆動性アニオン輸送体(SyHR)が示すリン酸輸送能と大腸菌べん毛運動の光操作への適用2021

    • Author(s)
      中西浩太郎, 小島慧一,曽和義幸,須藤雄気
    • Organizer
      第42回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
  • [Presentation] Development of light-induced disruptive liposome (LiDL) with an inward proton pump rhodopsin RmXeR2021

    • Author(s)
      Tsuneishi T, Kojima K, Kubota F, Yamada Y, Sudo Y
    • Organizer
      第 59回日本生物物理学会
  • [Presentation] Detection of membrane potential-dependent rhodopsin fluorescence with LED system for longterm imaging2021

    • Author(s)
      Kawanishi S, Kojima K, Shibukawa A, Sakamoto M, Sudo Y
    • Organizer
      第 59回日本生物物理学会
  • [Presentation] Optical control of apoptotic cell death by light-driven proton pumps2021

    • Author(s)
      Kojima K, Nakao S, Sudo Y
    • Organizer
      第 59回日本生物物理学会
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 光合成生物の形質転換体およびその用途2021

    • Inventor(s)
      須藤雄気, 小島慧一
    • Industrial Property Rights Holder
      須藤雄気, 小島慧一
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2021-89800
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 光により細胞死を制御する方法2021

    • Inventor(s)
      須藤雄気, 小島慧一, 中尾新
    • Industrial Property Rights Holder
      須藤雄気, 小島慧一, 中尾新
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      No.PCT/JP2021/043071
    • Overseas

URL: 

Published: 2022-12-28  

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