2023 Fiscal Year Research-status Report
Identification of somatic mutations promoting progression of EGFR-mutated lung adenocarcinoma
Project/Area Number |
21K15387
|
Research Institution | Saitama Medical University |
Principal Investigator |
松村 舞依 埼玉医科大学, 医学部, 非常勤講師 (50812997)
|
Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2025-03-31
|
Keywords | EGFR変異肺腺癌 / 微小乳頭状亜型 / 全エクソーム解析 / バイオインフォマティクス解析 / MUC21 / Visium 空間的遺伝子発現解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
我々の研究ではこれまでに、EGFR変異を有する肺腺癌(以下、EGFR肺腺癌)の悪性度が微小乳頭状亜型により規定されていることを明らかにした。更に同一腫瘍から微小乳頭状成分と非微小乳頭状成分をマイクロダイセクションで採り分け、次世代シーケンサーによる全エクソン解析を行い、微小乳頭状成分のみに起こっている遺伝子変異を同定、特に高悪性化に関連すると予想される20個の遺伝子からなる「高悪性度EGFR肺腺癌パネル」を作成した。また前年度より、「Visium 空間的遺伝子発現解析」を用いて、組織像を対比させることで、微小乳頭状成分と非微小乳頭状成分それぞれの遺伝子発現パターンを解析し、微小乳頭状成分で特異的に発現上昇している遺伝子変異3個と、発現低下している遺伝子20個を同定した。本年度は特に発現上昇している遺伝子変異3個について、症例を207例に拡張して免疫染色を行い、発現量を定量化するためにスコアリングを行った。その結果、3遺伝子の高発現群は脈管侵襲、特にリンパ管侵襲が有意に多くみられ、いずれもEGFR肺腺癌に強く発現していた。また、これらは微小乳頭状成分で特異的に高発現していることが示された(松村舞依 他, 日本病理学会学術総会, 2024年)。 この研究により、EGFR肺腺癌の高悪性度化、すなわち微小乳頭状亜型への分化に関わる主要な遺伝子を同定し、新規の予後予測マーカーや分子標的指標の確立に繋げたい。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
当該年度は、「Visium 空間的遺伝子発現解析」を用いて、微小乳頭状成分で特異的に発現上昇している遺伝子変異3個について、症例を207例に拡張して免疫染色を行い、発現量を定量化するためにスコアリングを行った。その結果、3遺伝子の高発現群は脈管侵襲、特にリンパ管侵襲が有意に多くみられ、いずれもEGFR肺腺癌に強く発現していた。また3遺伝子とも微小乳頭状成分で特異的に高発現していることが示された。 これらの3遺伝子の発現と、予後(術後再発率と生存率)との相関を統計学的に解析するにあたり、現在、予後データの収集に時間がかかっている。
|
Strategy for Future Research Activity |
Visiumで同定した、微小乳頭状成分に特異的に上昇している3遺伝子が免疫組織化学的にも微小乳頭状成分で高発現していることが示されたので、予後(術後再発率と生存率)との相関を統計学的に解析する。また、この成果を論文化する。
|
Causes of Carryover |
候補遺伝子と、予後(術後再発率と生存率)との相関を統計学的に解析するにあたり、現在、予後データの収集に時間がかかっている。 現在行っている予後(術後再発率と生存率)の統計解析終了後に、次年度中に一連の成果を論文化予定であり、次年度は論文の英文校正や投稿費用に使用する予定である。
|
Research Products
(8 results)