大腸粘膜下層浸潤癌におけるmicro RNA網羅的解析

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K15406
• Research Institution: Iwate Medical University
• Principal Investigator: 永塚 真 岩手医科大学, 医学部, 助教 (90815937)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: micro RNA / messenger RNA / 大腸癌

Outline of Annual Research Achievements

大腸粘膜下層浸潤癌（リンパ節転移例、非転移例）についてパラフィンからRNAを抽出した、いくつかの症例でRNAの抽出に難渋し一部固有筋層浸潤、漿膜下層浸潤症例も症例として追加した。術前化学療法が行われた症例、遺伝性腫瘍症例、免疫染色やMSI解析でMSIが示唆された症例は除外とした。結果としてリンパ節転移例18例, 非転移例21例で解析を行なった。網羅的miRNA解析はaffymetrix GeneChip miRNA Array 4.0を用いた。網羅的mRNA解析はaffymetrix Clario S human assayを用いた。リンパ節転移群と非転移群のmiRNA発現変動の比較はFDR p<0.05かつdelta Fold change>絶対値2を越えるものを抽出することとした。その結果8個のmiRNA (miR-4685-3p, 6754-3p, 6806-3p, 8085など)でup regulationを示した。down regulationを示したものは認めなかった。
up regulationを示したmiRNAとmRNAの相互関係をパスウェイ解析で検討した。miRNAでup regulationを示し、down regulationを示したmRNAは7パターンであった（TMEM243とmiR-206, 4685-3p, 6754-3p, METAP1とmiR-4685-39, CAMK4とmiR-8085, TGOLN2とmiR-6806-3p, 8085）。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

パスウェイ解析を施行しup regulationを示すmiRNAとdown regulationを示すmRNAの組み合わせを出した。

Strategy for Future Research Activity

算出したmiRNAでup regulationを示し、down regulationを示したmRNAの7パターンにおいて回帰性を検討し、リンパ節転移に影響を及ぼしうるmiRNA, mRNAの組み合わせを検討したい。