2023 Fiscal Year Annual Research Report
大腸粘膜下層浸潤癌におけるmicro RNA網羅的解析
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21K15406
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| Research Institution | Iwate Medical University |
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Principal Investigator |
永塚 真 岩手医科大学, 医学部, 助教 (90815937)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 大腸癌 / リンパ節転移 / micro RNA / messenger RNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
大腸粘膜下層浸潤癌(リンパ節転移例、非転移例)についてパラフィンからRNAを抽出した。いくつかの症例でRNAの抽出に難渋し一部固有筋層浸潤、漿膜下層浸 潤症例も症例として追加した。術前化学療法が行われた症例、遺伝性腫瘍症例、免疫染色やMSI解析でMSIが示唆された症例は除外とした。結果としてリンパ節転 移例18例, 非転移例21例で解析を行なった。網羅的miRNA解析はaffymetrix GeneChip miRNA Array 4.0を用いた。網羅的mRNA解析はaffymetrix Clario S human assayを用いた。リンパ節転移群と非転移群のmiRNA発現変動の比較はFDR p<0.05かつdelta Fold change>絶対値2を越えるものを抽出することとした。その結果8 個のmiRNA (miR-4685-3p, 6754-3p, 6806-3p, 8085など)でup regulationを示した。down regulationを示したものは認めなかった。
up regulationを示したmiRNAとmRNAの相互関係をパスウェイ解析で検討した。miRNAでup regulationを示し、down regulationを示したmRNAは7パターンであった (TMEM243とmiR-206, 4685-3p, 6754-3p, METAP1とmiR-4685-3p, CAMK4とmiR-8085, TGOLN2とmiR-6806-3p, 8085)。そのうち回帰性を認めたmiRNAとmRNAの組み合わせはMETAP1とmiR-4685-3p, TGOLN2とmiR-6806-3pであった。これらのmiRNAとmRNAの組み合わせがリンパ節転移に重要な役割を担う可能性が示唆された。
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