2022 Fiscal Year Annual Research Report
EBウイルスがT/NK細胞内で形成するスーパーエンハンサーの解析
| Project/Area Number |
21K15448
|
|---|
| Research Institution | Nagoya University |
|---|
Principal Investigator |
佐藤 好隆 名古屋大学, 医学系研究科, 准教授 (40754940)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2023-03-31
|
| Keywords | Epstein-Barrウイルス / スーパーエンハンサー / ゲノム立体構造 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
Epstein-Barrウイルス(EBV)は、B細胞を自然宿主とする普遍的なウイルスであるが、時にT細胞およびNK細胞にも感染し、節外性NK/T細胞リンパ腫や急速進行性NK細胞白血病や慢性活動性EBV感染症などの血液腫瘍の原因となる。これらのEBV関連T/NK細胞腫瘍は日本をはじめとした東アジアで報告が多く、予後不良で有効な治療法は未だ存在しない。
本研究では、細胞を特徴付ける転写プロファイルと密接な関係をもつスーパーエンハンサーを解析し、EBV関連T/NK細胞腫瘍に特異的なスーパーエンハンサーを同定した。そして、EBV特異的なスーパーエンハンサー構造をコントロールすることで、予後不良なEBV関連T/NK細胞腫瘍の新たな治療法の開発を目指した。
EBV陽性T細胞株 2株、EBV陰性T細胞株 1株、EBV陽性NK細胞株 2株、およびEBV陰性NK細胞株 1株の抗H3K27ac抗体を使用したChIP-seqとHiChIPを実施し、NGSデータの解析を実施した。同時に、各細胞の発現プロファイルをRNA-seq解析から得た。
EBV陽性T/NK細胞に特徴的なスーパーエンハンサーを形成しているゲノム領域を同定するとともに、ウイルスゲノムが感染細胞内で高次構造をとることを見出した。さらに、EBV陽性B細胞株であるLCLのHiChIPデータと比較することで、EBVの潜伏感染状態に応じて、ウイルスゲノム 内でのゲノム間相互作用の構造が異なることを見出し、EBV遺伝子発現におけるウイルスゲノムの高次構造の重要性を明らかにした。
|
-
-
-
-
-
-
[Presentation] シングルセルシーケンスを用いたEBウイルス関連血球貪食性リンパ組織球症の病態解析2022
Author(s)
鈴木高子, 佐藤好隆, 鳥居ゆか, 福田悠人, 春田一憲, 山口慎, 奥野友介, 濱麻人, 木村宏, 伊藤嘉規, 川田潤一
Organizer
第54回日本小児感染症学会総会・学術集会
-
-
-
