TTF-1の網羅的エピゲノム解析に基づくEGFR-TKI耐性獲得機序の解明

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K16112
• Research Institution: Niigata University
• Principal Investigator: 穂苅 諭 新潟大学, 医歯学総合病院, 特任助教 (00771213)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2025-03-31
• Keywords: 肺腺癌 / TTF-1 / EGFR遺伝子変異

Outline of Annual Research Achievements

EGFR遺伝子陽性の肺腺癌におけるTTF-1の役割に関して、継続して実験・解析を行った。Gene Expression Omnibusにて公開されているデータセットを用いて、EGFR遺伝子変異陽性肺腺癌の患者組織検体を用いた網羅的遺伝子発現データを解析した。EGFRチロシンキナーゼ(EGFR-TKI)阻害薬への治療前後で比較すると、Gene Ontology解析およびGene Set Enrichment解析を行ったところ、TTF-1低発現株とTTF-1高発現株ではEGFR-TKIの耐性機序は異なり、TTF-1高発現株では上皮間葉転換が耐性に関与していることが示唆された。これは、前年度のin vitro実験、EGFR遺伝子変異陽性肺腺癌細胞株の網羅的遺伝子発現データ解析の結果と合致するものであった。
その他、TTF-1の多面的作用の一部として腫瘍免疫にかかわる機能解析を行い、PD-L1を制御することで腫瘍免疫抑制的に働いていることが示唆された。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

遺伝子発現データ解析が進行している。

Strategy for Future Research Activity

今後、TTF-1抗体を用いたクロマチン免疫沈降シークエンスやTTF-1ノックダウン細胞株のRNAシークエンスの解析を進める予定である。また、TTF-1とPD-L1の関連性についても解析が進行中である。

Causes of Carryover

ChIP-seqの遺伝子発現データが未取得のため、追加実験で使用する予定である。
また、論文投稿・掲載費用にも使用する予定である。

Research Products

• [Presentation] 肺腺癌においてTTF-1はPD-L1発現を誘導し腫瘍免疫を抑制する (2023)
  • Author(s): 穂苅 諭, 関谷 友樹, 鈴木 遼, 菖野 邦浩, 桝田 尚明, 小山 建一, 三浦 理, 渡部 聡, 小屋 俊之, 田中 洋史, 菊地 利明
  • Organizer: 第63回日本呼吸器学会学術講演会
• [Presentation] EGFR遺伝子変異陽性肺腺癌細胞におけるTTF-1の機能解析～上皮間葉転換に注目して～ (2023)
  • Author(s): 福田 祐輝, 穂苅 諭, 関谷 友樹, 鈴木 遼, 菖野 邦浩, 桝田 尚明, 渡部 聡, 青木 信将, 大嶋 康義, 小屋 俊之, 菊地 利明
  • Organizer: 第63回日本呼吸器学会学術講演会 呼吸器病学ことはじめ
• [Presentation] G-CSF産生能小細胞肺癌の治療成績の検討 (2023)
  • Author(s): 板垣 智也, 野嵜 幸一郎, 田中 奨, 後藤 優佳, 鈴木 遼, 大坪 亜矢, 庄子 聡, 田中 知宏, 島 賢治郎, 才田 優, 穂苅 諭, 木村 陽介, 近藤 利恵, 青木 信将, 大嶋 康義, 渡部 聡, 小屋 俊之, 菊地 利明
  • Organizer: 第63回日本呼吸器学会学術講演会
• [Presentation] オシメルチニブによる薬剤性肺障害の実態と治療後のEGFR遺伝子変異非小細胞肺癌に対する治療選択に関する検討 (2023)
  • Author(s): 才田 優, 田中 奨, 後藤 優佳, 鈴木 遼, 大坪 亜矢, 庄子 聡, 田中 知宏, 野嵜 幸一郎, 島 賢治郎, 穂苅 諭, 木村 陽介, 近藤 利恵, 青木 信将, 大嶋 康義, 渡部 聡, 小屋 俊之, 菊地 利明
  • Organizer: 第63回日本呼吸器学会学術講演会
• [Presentation] がん薬物療法を受けた非結核性抗酸菌症併存悪性腫瘍の検討 (2023)
  • Author(s): 田中 知宏, 番場 祐基, 柴田 玲, 大坪 亜矢, 尾形 英至, 庄子 聡, 野嵜 幸一郎, 才田 優, 近藤 利恵, 穂苅 諭, 木村 陽介, 大嶋 康義, 茂呂 寛, 渡部 聡, 小屋 俊之, 菊地 利明
  • Organizer: 第63回日本呼吸器学会学術講演会
• [Presentation] 進行期肺癌治療におけるサルコペニアの影響を検討する前向き観察研究 (2023)
  • Author(s): 桝田 尚明, 渡部 聡, 菖野 邦浩, 後藤 優佳, 鈴木 遼, 関谷 友樹, 大坪 亜矢, 庄子 聡, 野嵜 幸一郎, 田中 知宏, 才田 優, 近藤 利恵, 島 賢治郎, 穂苅 諭, 木村 陽介, 青木 信将, 大嶋 康義, 小屋 俊之, 菊地 利明
  • Organizer: 第63回日本呼吸器学会学術講演会
• [Presentation] Nintedanib enhances antitumor effects of anti-PD-1 therapies through inhibition of immunosuppressive cells in tumor microenvironment (2023)
  • Author(s): R Suzuki, S Watanabe, K Shono, T Masuda, T Sekiya, Y Goto, T Fujisaki, M Arita, A Ohtsubo, S Shoji, T Tanaka, K Nozaki, R Kondo, Y Saida, S Hokari, R Ohashi, K Shima, Y Kimura, N Aoki, Y Ohshima, T Koya, T Kikuchi
  • Organizer: AACR annual meeting
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] PD-1 blockade therapy enhances the antitumor effects of lymphodepletion and adoptive T cell transfer (2023)
  • Author(s): Satoshi Watanabe, Miho Takahashi, Ryo Suzuki, Masashi Arita, Ko Sato, Toshiya Fujisaki, Aya Ohtsubo, Satoshi Shoji, Kunihiro Shono, Takaaki Masuda, Tomoki Sekiya, Koichiro Nozaki, Tomohiro Tanaka, Rie Kondo, Yu Saida, Satoshi Hokari, Toshiyuki Koya, Toshiaki Kikuchi
  • Organizer: AACR annual meeting
  • Int'l Joint Research