大腸ポリポーシス患者の遺伝学的検討ー新たなサーベイランスの確立を目指してー

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K16437
• Research Institution: Tokyo Metropolitan Hospital Organization Tokyo Metropolitan Komagome Hospital
• Principal Investigator: 高雄 美里 地方独立行政法人東京都立病院機構東京都立駒込病院(臨床研究室), 大腸外科, 医員 (10799547)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: ポリポーシス / 体細胞モザイク / 家族性大腸腺腫症 / 遺伝性腫瘍 / FAP / デスモイド腫瘍 / 十二指腸腺腫

Outline of Annual Research Achievements

本年度より本格的に研究開始となった。
当院で大腸ポリポーシスに対してサーベイランスを行っている32例を対象とした。対象症例に対し、患者血液を用いて次世代シークエンサーによるポリポーシス原因遺伝子（APC, AXIN2, GREM1, MUTYH, MSH3, NTHL1,POLE, POLD1, RNF43）の検索を行った。必要に応じてMLPA法やサンガーシークエンスを行った。APC遺伝子の病的バリアントが同定された症例は14例、MUTYH遺伝子の病的バリアントが同定された症例が1例であった。残りの17例に関しては血液を用いた遺伝学的検査では明らかな原因遺伝子は同定できなかった。
上記検索でバリアントが同定されなかった症例のうち大腸ポリープの組織採取が可能であった症例において体細胞モザイクの検索を行った。大腸内視鏡施行時に採取した大腸生検検体からQIAamp DNA mini kitを用いてDNAを抽出し、APC遺伝子のバリアントを検索した。異なる2か所以上で同様のバリアントが同定された場合をAPC体細胞モザイクとした。今年度中に来院し検体採取に同意が得られた症例は1例であったが、本症例では異なる2か所の大腸生検からAPC c.896_897delCTのバリアントが同定され、体細胞モザイクと判断した。
遺伝学的検査で明らかな原因遺伝子が同定されなかった症例のうち、過去に手術や内視鏡的切除の際に保存しているFFPE検体がある場合にはFFPEよりDNAを抽出し解析を行ったが、経過年数が長いほどDNAの回収率が悪く解析困難であった。患者同意のもと、新たな検体採取が望ましいと思われた。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

研究計画では①患者血液を用いたポリポーシス原因遺伝子の同定、②患者組織及び血液を用いたAPC体細胞バリアントの同定、③原因遺伝子ごとの臨床病理学的特徴の解析を行う予定である。
①に関してはおおむね順調に経過しているが、当初の予定より1年遅れて研究開始となったため症例集積に遅れが生じている。また、保存検体からの解析が困難であったことから新たな検体採取が必要となった。

Strategy for Future Research Activity

今後も引き続き①患者血液を用いたポリポーシス原因遺伝子の同定、②患者組織及び血液を用いたAPC体細胞バリアントの同定を行う。得られたシークエンス結果について、原因遺伝子ごとの臨床病理学的特徴の解析を行う。本年度は論文化を行う予定である。

Causes of Carryover

本年度は妊娠出産があり学会発表等に参加できず、旅費等は予定より少額となった。