• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Research-status Report

シングルセル解析による外傷後肺障害の病態解明

Research Project

Project/Area Number 21K16585
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

千田 篤  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 非常勤講師 (00728040)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords外傷出血性モデル / 多臓器障害 / エクソソーム / シングルセル / プロテオーム解析 / 脂質解析 / miRNA
Outline of Annual Research Achievements

280-300mg のオスの ラットを開腹し上腸間膜動脈の血流遮断を行った。1時間後再開腹し遮断を開放し 2 時間の 再灌流期を設け腸管リンパ液の採取を行った。血流遮断時に確実に腸管血流が止まっている事を確認するため、レーザードップラー計にて腸管血流が血流遮断時間全体を通して遮断されている事を確認した。また再還流後の腸管が壊死に至っていない事を病理学的確認を行うとともに、肺障害が起きている事を確認するために肺障害の病理学的に確認するとともに肺胞洗浄液中の炎症細胞の増加を確認している。腸管上皮細胞由来の細胞において虚血、再還流後のエクソソームを回収し、エクソソームの同定および定量を電子顕微鏡、ウエスタンブロット、粒子トラッキング装置を用いて行った結果、目的とするのサンプルが十分量得られている事が確認された。さらに得られたサンプルに生理的活性がある事を確認するため単球系細胞におけるNF-kB産生が行われている事を確認した。さらに得られた検体についてmRNA解析、タンパク解析、脂質解析を行った結果mRNAについては大きな変化はないものの、多様な炎症に関わるタンパク質の量変化が確認された。また不飽和脂肪酸含有LPCの増加を確認した。また同時にsingle cell RNA-seqを行うためサンプルについての実験に適した条件および、生理活性を調べるために必要となる様々な条件下におけるエクソソームの採取作業を進めている。今後としては解析のための至適条件を決めた定段階でn=3程度の検体でパイロット試験を行った後に本試験へと進み解析を行う予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

虚血再還流モデル、エクソソーム抽出方法などは概ね定まり、その生理活性の確認、肺障害の程度およびエクソソーム内容物についてのタンパク解析、脂質解析、miRNA PCRなどによる変化についての解析は終えている。一方で当初予定していたよりもエクソソームの回収率が低く、本実験を行うために必要なエクソソームの回収に時間がかかっている状態である。エクソソーム回収率を上げるための試行錯誤は行っているが、回収率を上げると純度が下がる傾向があったため当面当初から予定していた超遠心分離による検体採集を続けていく予定である。

Strategy for Future Research Activity

引き続きエクソソームを着実に回収していき、純度の高い検体にて実験を行う予定である。やや実験に遅れが出ているためin vivoな実験系とin vitroな実験系を並行して進めていく予定である。

Causes of Carryover

従来計画していた動物実験の本実験が始まっていないためそれに伴う諸費用が未使用であり、今後使用する予定である。今後引き続きエクソソームの回収に必要な物品および細胞の継代に必要な薬剤の購入費用および生理的活性を調べるための測定系を組むための細胞株の購入および抗体の購入に使用する予定である。

  • Research Products

    (1 results)

All 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results)

  • [Journal Article] Vagus nerve stimulation modulates arachidonic acid production in the mesenteric lymph following intestinal ischemia-reperfusion injury2021

    • Author(s)
      Nakatsutsumi Keita、Morishita Koji、Yagi Masayuki、Doki Sanae、Watanabe Arisa、Ikegami Nahoko、Kobayashi Testuyuki、Kojima Mitsuaki、Senda Atsushi、Yamamoto Kouhei、Aiboshi Junichi、Coimbra Raul、Otomo Yasuhiro
    • Journal Title

      Journal of Trauma and Acute Care Surgery

      Volume: 91 Pages: 700~707

    • DOI

      10.1097/TA.0000000000003345

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi