グリオーマ遺伝子パネルによる日本人グリオーマ患者での網羅的ゲノム・エピゲノム解析

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K16636
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: 比嘉 那優大 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (90792200)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: GBM / EGFR / PDGFRA / TERTp / 遺伝子パネル

Outline of Annual Research Achievements

当科で摘出手術および加療が行われた138例のIDH-wildtype glioblastoma (GBM)患者の FFPE検体からDNAを抽出し、脳腫瘍に特化した50遺伝子の遺伝子パネル検査を行った。GBMで頻度の高い、PDGFRAとEGFRの二つのチロシンキナーゼ受容体について検討を行った。PDGFRAに関しては、PDGFRA ampを29.6%に認めた。PDGFRA amp群は、non-amp群より高齢（p = 0.044）、Ki-67高値（p = 0.012）であった。PDGFRA amp群はnon-amp群と比較して有意に予後不良であった（生存期間中央値：15.2ヶ月 vs 29.5ヶ月, p = 0.002）。またEGFRに関しては、EGFR ampもしくはmutationを29.2%に認めた。EGFR変異のうち、25 %はキナーゼドメインに変異を認めた。EGFR amp and/or mutation群は、wild群よりKPSが高く（p = 0.014）、Ki-67低値（p = 0.005）であった。EGFR amp and/or mutation群はwild群と比較して有意に予後良好であった（生存期間中央値：29.5ヶ月 vs 18.7ヶ月, p = 0.035）。また我々の日本人コホートでは、欧米と比較してTERTp変異とEGFR変異の割合が低いが、PDGFRA変異の割合が高く、日本と欧米ではGBMの遺伝子プロファイルが異なる可能性が示唆された。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

すでに研究成果を論文にまとめ、現在投稿中である。

Strategy for Future Research Activity

さらに症例数を増やして、GBMだけでなくその他のgliomaについても解析を行う。また現在、脳腫瘍に特化した融合遺伝子パネルを開発中であり、遺伝子変異、コピー数変異に加えて融合遺伝子解析を行う。

Causes of Carryover

次年度の研究計画に繰り越す予定。