グリオーマ遺伝子パネルによる日本人グリオーマ患者での網羅的ゲノム・エピゲノム解析

2022 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21K16636
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: 比嘉 那優大 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (90792200)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: EGFR / PDGFRA / TERTp / ARID1A / 遺伝子パネル

Outline of Annual Research Achievements

カスタム遺伝子パネル検査を用いてグリオーマの遺伝子解析を行い、膠芽腫ではEGFR遺伝子変化が予後良好因子であることを見出した。また欧米と比較して日本人ではEGFR遺伝子変異の頻度は低いが、EGFRキナーゼドメインに変異をもつ割合が高いことを見出した。
また膠芽腫ではPDGFRA gain/ampが予後不良因子であり、MGMTpメチル化とPDGFRA gain/ampを組み合わせることで予後の層別化が可能であることを見出した。
300例以上のグリオーマの解析において、日本人グリオーマ患者の遺伝子プロファイルを明らかにした。日本人においては、膠芽腫ではTERTp変異、EGFR遺伝子変化の割合が海外と比較すると低いが、PDGFRA遺伝子変化の割合が高いことを報告し、人種差があることを明らかにした。WHO2021脳腫瘍分類では分類不能であるNECが相当数存在することを見出し、さらなる分子マーカーの創出が必要であることを提起した。Oligodendroglial tumorではARID1A変異が予後不良因子であることを見出した。
以上のように、当該研究により日本人グリオーマ患者の遺伝子プロファイルを明らかにし、いくつかの予後バイオマーカーを発見することに成功した。今後、これらの知見をもとに個別化医療につながる可能性が示唆された。

Research Products

• [Journal Article] Distribution and favorable prognostic implication of genomic EGFR alterations in IDH-wildtype glioblastoma. (2022)
  • Author(s): Higa N, Akahane T, Hamada T, Yonezawa H, Uchida H, Makino R, Watanabe S, Takajo T, Yokoyama S, Kirishima M, Matsuo K, Fujio S, Hanaya R, Tanimoto A, Yoshimoto K
  • Journal Title: Cancer Medicine Volume: 12 Pages: 49～60
  • DOI: 10.1002/cam4.4939
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Prognostic impact of PDGFRA gain/amplification and MGMT promoter methylation status in patients with IDH wild-type glioblastoma (2022)
  • Author(s): Higa N, Akahane T, Yokoyama S, Yonezawa H, Uchida H, Takajo T, Otsuji R, Hamada T, Matsuo K, Kirishima M, Hata N, Hanaya R, Tanimoto A, Yoshimoto K
  • Journal Title: Neuro-Oncology Advances Volume: 4 Pages: -
  • DOI: 10.1093/noajnl/vdac097
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Molecular Genetic Profile of 300 Japanese Patients with Diffuse Gliomas Using a Glioma-tailored Gene Panel (2022)
  • Author(s): Higa N, Akahane T, Yokoyama S, Yonezawa H, Uchida H, Fujio S, Kirishima M, Takigawa K, Hata N, Toh K, Yamamoto J, Hanaya R, Tanimoto A, Yoshimoto K
  • Journal Title: Neurologia medico-chirurgica Volume: 62 Pages: 391～399
  • DOI: 10.2176/jns-nmc.2022-0103
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] IDH wild-type GBMにおけるPDGFRA amplificationの予後への影響 (2022)
  • Author(s): 比嘉 那優大
  • Organizer: 日本分子脳外科学会
• [Presentation] IDH wild-type GBMにおけるPDGFRA amplificationおよびMGMTpメチル化の予後への影響 (2022)
  • Author(s): 比嘉 那優大
  • Organizer: 日本脳腫瘍病理学会
• [Presentation] カスタム遺伝子パネルを用いて解析したグリオーマ300例の遺伝子プロファイルとWHO2021分類に基づく再分類 (2022)
  • Author(s): 比嘉 那優大
  • Organizer: 日本脳神経外科学会総会
• [Presentation] カスタムNGSパネルを用いたグリオーマ300例の解析-分子プロファイルの特徴と予後バイオマーカー- (2022)
  • Author(s): 比嘉 那優大
  • Organizer: 日本脳腫瘍学会