筋肉内粘液腫における最適なGNAS遺伝子スクリーニング法の開発

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K16650
• Research Institution: Shinshu University
• Principal Investigator: 鬼頭 宗久 信州大学, 医学部附属病院, 助教(診療) (60624707)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 筋肉内粘液腫 / GNAS遺伝子 / 次世代シーケンサー / 遺伝子解析

Outline of Annual Research Achievements

筋肉内粘液腫は良性の軟部腫瘍であるが、粘液性悪性軟部腫瘍（特に低悪性度粘液線維肉腫）との鑑別が困難な場合が多い。良性腫瘍と悪性腫瘍では治療方法が大きく異なるため、臨床医にとって治療方針の決定に苦慮する厄介な軟部腫瘍である。筋肉内粘液腫は、GNAS遺伝子のミスセンス突然変異が報告されている。次世代シーケンサーの登場によりこれまでにExon8 Arg201・Exon9 Gln227のミスセンス突然変異が報告されており、GNAS変異の同定は粘液性悪性軟部腫瘍との鑑別に有用と考えられる。本研究では、まず検体量の多い手術検体での筋肉内粘液腫のGNAS遺伝子のミスセンス突然変異を次世代シーケンサー・PCRダイレクトシーケンス法で解析を行った。次世代シーケンサーでの解析では、9検体中5検体で従来報告されているGNASの遺伝子変異（Exon8: Arg201Cys, Arg201His）が検出された。またPCRダイレクトシーケンス法では、Exon8 Arg201の変異は9検体中3例(Arg201Cys 2例、Arg201His 1例)で検出され、Exon9 Gln227の変異は7検体中で検出されたものはなかった。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

手術検体における筋肉内粘液腫のGNAS遺伝子変異検索は、次世代シーケンサーでは9検体中5検体で従来の遺伝子変異を同定できた。またPCRダイレクトシーケンス法では、9検体中3検体のみ変異が検出された。筋肉内粘液腫は腫瘍細胞割合が少ないためPCRダイレクトシークエンス法では変異検出感度が低いことが予想された。現時点ではすべての対象手術検体での遺伝子検索がまだ終了していないため当初の予定より若干進捗状況は遅れている。

Strategy for Future Research Activity

手術検体の遺伝子検索をすべて行い、その後生検検体での遺伝子検索を行っていく。またPCRダイレクトシークエンス法より高感度のPCRベースの検査方法を検討していき、最適にGNAS変異を同定できる解析方法を検索していく。

Causes of Carryover

次世代シーケンサーによる遺伝子検索が当初の予定より若干遅れているため、次年度使用額が生じた。次年度使用額は令和4年度請求額と合わせて消耗品費として使用する予定である。