新規口腔がん関連長鎖非コードRNA DLEU1の病的意義の解明と臨床応用

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K17094
• Research Institution: Sapporo Medical University
• Principal Investigator: 西山 廣陽 札幌医科大学, 医学部, 助教 (60749563)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 口腔がん

Outline of Annual Research Achievements

これまで申請者らは口腔がんの進展に関与するlncRNAをスクリーニングし、新規口腔がん関連lncRNAとしてDLEU1 (deleted in lymphocytic leukemia 1)を同定した(Cell Death Dis, 2018)。我々はThe Cancer Genome Atlas (TCGA)が公開している頭頸部扁平上皮癌のRNA-seqデータを解析し、がん組織において過剰発現するlncRNAを抽出した。さらにその中から、DLEU1のノックダウンが口腔がん細胞の増殖、遊走・浸潤、in vivo腫瘍形成能を強く抑制することを見いだした。また我々はDLEU1の下流標的遺伝子としてHAS3 (Hyaluronic synthase 3)、CD44、TP63を同定した。これらの遺伝子発現はDLEU1ノックダウンにより抑制され、TCGAデータ解析ではこれらとDLEU1発現の間に正の相関が見られた。HA (Hyaluronic acid)-CD44シグナルは、口腔がんの進展を促すことが知られている。また近年、ΔNp63がHAS3やCD44の発現を直接制御することで、HA-CD44シグナルを活性化することが報告されている。本研究では、口腔がんにおけるDLEU1の詳細な分子機能、特にDLEU1とHA-CD44を結ぶ作用機序とその臨床的意義を明らかにする事で、診断・治療に応用しうる知見を得られる可能性が示唆された

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

DLEU1と正の相関をもって発現する標的遺伝子候補を同定した。しかしながらその直接的な作用機序の同定には至っていないため。

Strategy for Future Research Activity

ChIRP (Chromatin isolation by RNA purification)法により、DLEU1のゲノムDNA上の結合領域およびDLEU1と相互作用するタンパクを網羅的に探索する。DLEU1をベイトとし、回収したゲノムDNAをdeep sequence解析する(ChIRP-seq)。DLEU1ノックダウンあるいは過剰発現が遺伝子発現に与える影響をマイクロアレイで解析し、ChIRP-seqデータを統合することで、DLEU1標的遺伝子を同定する。

Causes of Carryover

コロナ禍により診療スケジュールに支障が生じ、実験に充てる時間を縮小せざるを得なかったため。