2023 Fiscal Year Research-status Report
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21K17858
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| Research Institution | Nagasaki University |
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Principal Investigator |
松本 拡高 長崎大学, 情報データ科学部, 准教授 (90782045)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2026-03-31
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| Keywords | グラフフーリエ変換 / ネットワーク解析 / 系統解析 / インフルエンザウイルス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
昨年度に論文化を進めていた、配列情報などからサンプル感の類似性グラフを構築し、グラフフーリエ変換を用いて形質情報を解析する理論であるNeTaGFTを改良するとともに、公開のための手続きを進めた。本手法および本手法をもちいてインフルエンザウイルスなどを解析した結果は論文としてまとめ、査読者によるコメントなどを参考に修正するとともに、マニュアルなどの整備を行ったうえでGitHub上で公開した。また、本成果はMethods in Ecology and Evolution誌に受理され、オープンアクセスとして公開している。
また、今年度より新たに寄生虫のゲノム解析を始めた。特に、Plasmodium、Torypanosoma、Leishmania等のゲノム構造の進化を含めた特徴解析を、新たな理論によって紐解くことを目指し、手法の開発と解析を進めている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
昨年度より論文化を進めた成果をMethods in Ecology and Evolution誌に受理されるとともに、手法自体もGitHub上で誰でも利用できるように整備し、手法及び結果を誰もが利用できる形で公開するなど、概ね順調に進展している。また、寄生虫の進化という新たな生命現象の解析へも発展させるなど、順調に進んでいる。
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| Strategy for Future Research Activity |
あらたに寄生虫のゲノム情報を対象に、その進化的な意義も含めた特徴解析を進めている。これら解析に求められる新たな手法を開発するとともに、寄生虫という新たな対象に貢献しうる新しいアプローチの提唱と発見を目指したい。
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| Causes of Carryover |
当該年度は昨年度より繰越した費用を論文投稿費にあてることで、予算内で本研究を進めることができた。また、若干の予算が使用せずに残ったが、これらは新たな論文投稿に向けた費用として次年度使用額に回すこととする。
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