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2022 Fiscal Year Annual Research Report

微生物が潜在的に有するケミカルシグナル応答機構を利用した天然化合物の生産誘導

Research Project

Project/Area Number 21K19099
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

高橋 俊二  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, ユニットリーダー (30311608)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2023-03-31
Keywordsケミカルシグナル / 微生物二次代謝産物 / 天然化合物 / 生産誘導 / βーカルボリン / 放線菌 / 転写制御因子 / リベロマイシン
Outline of Annual Research Achievements

二次代謝産物を生産菌することで知られる放線菌から、抗生物質、抗がん剤、免疫抑制剤、農薬となる有用化合物が単離されている。現在でも、強い生理活性を有する微生物代謝産物の重要性は非常に高く、生産誘導機構を解明し、放線菌ゲノム中に存在する生合成遺伝子クラスターを活性化することによって医薬・農薬シーズとなる天然化合物の創出が望まれている。これまでに、二次代謝物の生産を誘導するケミカルシグナルとして「β-カルボリン」を見出している。そこで、β-カルボリン誘導体(BR-1)に応答する標的分子の作用機構を解析した。また、放線菌に組み込まれているシグナル受容機構を解明することによって、遺伝子操作を行わずに天然化合物の生産を誘導する手法の検討を継続して行った。
最適化合成シグナルの開発:BR-1結合によるATP結合阻害により、RevU構造を標的DNA結合型に誘導する機構を検討するため、人工合成遺伝子を用いて可溶化RevU蛋白質を大腸菌で異種発現し、精製効率を改善することに成功した。また、市販の阻害剤を用いてRM-A生産誘導を評価した結果、生産性を増強する分子を見出した。
BR-1を用いた新規天然化合物探索:有用天然物の探索源として知られる放線菌にはLAL family転写制御因子群が存在する。そこで、独自に土壌より取得した放線菌を用い、BR-1およびその誘導体を添加して培養したところ、生産誘導される代謝産物の取得に成功した。次に、本化合物の取得に向けて大量培養を行い、培養液を各種カラムクロマトグラフィーにより精製し、目的化合物を得た。現在NMR測定を行い、構造を解析している。また、BR-1およびその誘導体により発現が誘導される遺伝子の同定と発現制御機構の解明のために標的放線菌のゲノム解読を行い、候補遺伝子クラスターの情報を取得した。

  • Research Products

    (12 results)

All 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Identification and Characterization of Bifunctional Drimenol Synthases of Marine Bacterial Origin2022

    • Author(s)
      Vo Nhu Ngoc Quynh、Nomura Yuhta、Kinugasa Kiyomi、Takagi Hiroshi、Takahashi Shunji
    • Journal Title

      ACS Chemical Biology

      Volume: 17 Pages: 1226~1238

    • DOI

      10.1021/acschembio.2c00163

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal structures of a 6-dimethylallyltryptophan synthase, IptA: Insights into substrate tolerance and enhancement of prenyltransferase activity2022

    • Author(s)
      Suemune Hironori、Nishimura Doukan、Mizutani Kenjiro、Sato Yusuke、Hino Tomoya、Takagi Hiroshi、Shiozaki-Sato Yumi、Takahashi Shunji、Nagano Shingo
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 593 Pages: 144~150

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.01.018

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation of new lucilactaene derivatives from P450 monooxygenase and aldehyde dehydrogenase knockout Fusarium sp. RK97-94 strains and their biological activities2022

    • Author(s)
      Abdelhakim Islam A.、Motoyama Takayuki、Nogawa Toshihiko、Mahmud Fauze Bin、Futamura Yushi、Takahashi Shunji、Osada Hiroyuki
    • Journal Title

      The Journal of Antibiotics

      Volume: 75 Pages: 361~374

    • DOI

      10.1038/s41429-022-00529-3

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Studies on Streptomyces sp. SN-593: reveromycin biosynthesis, β-carboline biomediator activating LuxR family regulator, and construction of terpenoid biosynthetic platform2022

    • Author(s)
      Takahashi Shunji
    • Journal Title

      The Journal of Antibiotics

      Volume: 75 Pages: 432~444

    • DOI

      10.1038/s41429-022-00539-1

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Biosynthetic study of verticilactam, a polycyclic macrolactam from Streptomyces2023

    • Author(s)
      Yu ZHENG, Katsuyuki SAKAI, Hiroshi TAKAGI, Yumi SHIOZAKI-SATO, Toshihiko NOGAWA, Shunji TAKAHASHI
    • Organizer
      4th International Conference on Natural Products Discovery and Development in the Genomic Era
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 岡村英治、佐藤(汐﨑)裕美、奥村英夫、熊坂崇、長田裕之、高橋俊二2023

    • Author(s)
      Reveromycin A生合成酵素RevK-RevL複合体モデル構造に基づくRevL変異導入酵素の解析と相互作用領域決定
    • Organizer
      日本農芸化学会
  • [Presentation] Crystal structure analysis of drimenol synthase from marine bacterium.2023

    • Author(s)
      Keisuke FUJIYAMA, Vo Ngoc Quynh NHU, Shunji TAKAHASHI
    • Organizer
      日本農芸化学会
  • [Presentation] New elasnin derivatives identified by expression of a SARP family regulatory gene.2023

    • Author(s)
      Islam Amin, Jun Ishikawa, Sachiko Masuda, Ken Shirasu, Shunji Takahashi
    • Organizer
      日本農芸化学会
  • [Presentation] Biosynthetic study of verticilactam, a polycyclic macrolactam from Streptomyces2023

    • Author(s)
      Yu ZHENG, Katsuyuki SAKAI, Hiroshi TAKAGI, Yumi SHIOZAKI-SATO, Toshihiko NOGAWA, Shunji TAKAHASHI
    • Organizer
      日本農芸化学会
  • [Presentation] リベロマイシンA生合成に関わる複合酵素の鍵相互作用残基の同定2022

    • Author(s)
      岡村英治、 佐藤(汐﨑)裕美、奥村英夫、 熊坂崇、長田裕之、高橋俊二
    • Organizer
      日本放線菌学会
  • [Presentation] Identification of elasnin derivatives by expression of regulatory gene2022

    • Author(s)
      Islam A. Abdelhakim, Naoko Kito, Sachiko Masuda, Ken Shirasu, Jun Ishikawa, and Shunji Takahashi
    • Organizer
      日本放線菌学会
  • [Presentation] Discovery of novel bifunctional drimane sesquiterpene synthases from marine bacteria.2022

    • Author(s)
      Nhu Ngoc Quynh Vo, Yuhta Nomura, Kiyomi Kinugasa, Hiroshi Takagi, Yumi Shiozaki-Sato, and Shunji Takahashi
    • Organizer
      天然有機化合物討論会

URL: 

Published: 2023-12-25  

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