2022 Fiscal Year Annual Research Report
Identification of Cryptic exon by long RNA sequencing
| Project/Area Number |
21K19213
|
|---|
| Research Institution | Gifu University |
|---|
Principal Investigator |
宮脇 慎吾 岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授 (70756759)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2021-07-09 – 2023-03-31
|
| Keywords | Cryptic exon / 長鎖RNAシーケンス / ゲノム編集 / マウス |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
隠れエキソン(Cryptic exon)は、特定の細胞・時期・病態の転写産物のバリアントを構成するエキソンである。これまでの研究によって申請者は、性決定期の生殖腺体細胞のトランスクリプトームのデータから未知のCryptic exonが他の遺伝子にも潜んでいる可能性を探索した。すなわち、長鎖RNAシーケンスおよびCap Analysis of Gene Expression(CAGE)シーケンスから転写産物の多様性を明らか にすることで、Cryptic exonが潜む転写産物を同定することができる。
本年度は、生殖腺でCryptic exonの探索を実施したところ、Sryの転写調節に重要な役割を持つことが知られているGata4において、これまでに知られていない Cryptic exonを見出した。このCryptic exonをゲノム編集でエキソンを挟んだ領域を切断し、Cryptic exonの欠損マウスを作出した。現在、このマウスを交配により系統化を進めている。
|
