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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Novel time-resolved biosensor based on plasmon enhanced grating method

Research Project

Project/Area Number 21K19218
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

寺嶋 正秀  京都大学, 理学研究科, 教授 (00188674)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岡本 晃一  大阪公立大学, 大学院工学研究科, 教授 (50467453)
Project Period (FY) 2021-07-09 – 2023-03-31
Keywordsタンパク質 / 反応 / 時間分解 / 回折格子
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、タンパク質分子間の相互作用機構を解明するための新しいバイオセンサーを開発することを目的とし、強いプラズモン共鳴が可能になる銀基板上の銀ナノ半球構造と、回折格子法を組み合わせたシステムを作製する。これを用いて、ヘテロダインの過渡回折格子検出装置や励起光が必要ないバイオセンサーを作製する計画である。このために、銀ナノ半球構造を回折格子状に並べた基板を作製した。この基盤に連続発振のレーザーを照射したところ、適度な強度の回折光が得られ、それを光検出器でモニターできることが分かった。次にこの基盤を、光を吸収する分子の溶液を入れたセルに密着し、ヘテロダイン過渡回折格子信号を観測することを試みた。溶液をパルスレーザー光で励起子したあと、回折光の強度が時間とともに変化することが見られ、ヘテロダイン過渡回折格子信号を観測することに成功した。しかし、この信号は予想されたよりも微弱な信号であった。
この原因として、回折光の強度が時間とともに減少することが明らかにできた。また、溶液交換によっても強度減少が見られた。これの原因を追及したところ、銀ナノ半球構造体が光照射や溶液交換の過程で劣化していることが判明した。これを改善するために、銀ナノ半球構造体をポリマーで保護することを検討し、その基盤の作成を行った。その結果、ポリマーで保護することで、通常では見られない大きな波長選択性が得られ、特定の波長域の光のみを選択的に回折できた。これを用いて溶液中での過渡回折格子信号を検出したところ、再現性のある信号が得られ、バイオセンサーとしての性能を確認できた。また、これまで通常の過渡回折格子法で溶液中でのタンパク質会合を回折光変化として検出できるかどうかを試み、我々が開発してきたeBLUFと呼ばれるタンパク質の会合を、微小体積で検出することができた。

  • Research Products

    (24 results)

All 2023 2022

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 1 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] プラズモニクスに基づくIII-V 族窒化物半導体の高効率緑色発光2023

    • Author(s)
      岡本晃一,垣内晴也,亀井勇希,松山哲也,和田健司,船戸充,川上養一
    • Journal Title

      レーザー研究

      Volume: 51 Pages: 97-102

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enhancement of the bandgap emission from GaN epilayer by surface plasmon resonance in the quadrupole oscillation mode using Ag nanoparticles protected by an oxide thin film2023

    • Author(s)
      S. Kaito, T. Matsuyama, K. Wada, M. Funato, Y. Kawakami, K. Okamoto
    • Journal Title

      Applied Physics Letters

      Volume: 122 Pages: in press

    • DOI

      10.1063/5.0143725

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selective Photoinduced Dimerization and Slow Recovery of a BLUF Domain of EB12022

    • Author(s)
      K. Shibata, Y. Nakasone, M. Terazima
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 126 Pages: 1024-1033

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.1c10100

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Slow conformational changes of blue light sensor BLUF proteins in milliseconds2022

    • Author(s)
      S. Tokonami, M. Onose, Y. Nakasone, M. Terazima
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 144, 9 Pages: 4080-4090

    • DOI

      10.1021/jacs.1c13121

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Salt effect on the selective photoinduced dimerization of a BLUF domain of EB12022

    • Author(s)
      K. Shibata, Y. Nakasone, M. Terazima
    • Journal Title

      J. Mol. Liq.

      Volume: 361 Pages: 119606 (1-10)

    • DOI

      10.1016/j.molliq.2022.119606

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Usefulness of higher-order system-size correction for macromolecule diffusion coefficients: A molecular dynamics study2022

    • Author(s)
      T. Iwashita, M. Nagao, A. Yoshimori, M. Terazima, R. Akiyama
    • Journal Title

      Chem. Phys. Lett.

      Volume: 807 Pages: 140096 (1-7)

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2022.140096

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Revealing protein reactions using transient grating method: Photo-induced heating, volume change, and diffusion change2022

    • Author(s)
      M. Terazima
    • Journal Title

      J. Appl. Phys.

      Volume: 131 Pages: 140902 (1-13)

    • DOI

      10.1063/5.0087049

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Time-resolved diffusion reveals photoreactions of BLUF proteins with similar functional domains2022

    • Author(s)
      Y. Nakasone. M. Terazima
    • Journal Title

      Photochem. Photobiol. Sci.

      Volume: 21 Pages: 493-507

    • DOI

      10.1007/s43630-022-00214-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Applications of time-resolved thermodynamics for studies on protein reactions2022

    • Author(s)
      M. Terazima
    • Journal Title

      J

      Volume: 5 Pages: 186-197

    • DOI

      10.3390/j5010014

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Time-resolved detection of association/dissociation reactions and conformation changes in photosensor proteins for application in optogenetics2022

    • Author(s)
      M. Terazima
    • Journal Title

      BioPhys. Rev.

      Volume: 13 Pages: 1053-1059

    • DOI

      10.1007/s12551-021-00868-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deep-ultraviolet localized surface plasmon resonance using Ga nanoparticles2022

    • Author(s)
      S. Endo, K. Shimanoe, T. Matsuyama, K. Wada, K. Okamoto
    • Journal Title

      Optical Materials Express

      Volume: 12 Pages: 2444-2452

    • DOI

      10.1364/OME.456061

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 光センサーBLUFタンパク質の信号伝達機構2023

    • Author(s)
      中曽根祐介、寺嶋正秀
    • Organizer
      日本化学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 光センサータンパク質PYPと下流分子PBPの相互作用ダイナミクスとその多様性2023

    • Author(s)
      平田瑞樹、中曽根祐介、金穂香、寺嶋正秀
    • Organizer
      日本化学会年会
  • [Presentation] オレンジカロテノイドタンパク質の光二量化機構2023

    • Author(s)
      渡嘉敷直志、大畑貴聖、床次俊郎、中曽根祐介、寺嶋正秀
    • Organizer
      日本化学会年会
  • [Presentation] 青色光センサーeBLUFの光ダイマー化機構と溶液構造解析2022

    • Author(s)
      中曽根祐介、柴田耕生、古川亜矢子、西村善文、寺嶋正秀
    • Organizer
      分子科学討論会
  • [Presentation] Time-resolved Diffusion Method reveals Spectrally Hidden Protein Reactions2022

    • Author(s)
      Masahide Terazima
    • Organizer
      溶液化学シンポジウム
  • [Presentation] Stabilization of decamer structure by the C-terminal region of the blue light sensor protein SyPixD2022

    • Author(s)
      Shunrou Tokonami, Yusuke Nakasone, Masahide Terazima
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Light-dependent reversible molecular assembly of a blue light sensor protein TePixD2022

    • Author(s)
      Yusuke Nakasone, Yusuke Masuda, Shunrou Tokonami, Masahide Terazima
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Time-resolved detection of photoinduced heating and volume changes during protein reactions2022

    • Author(s)
      Masahide Terazima
    • Organizer
      21st International Conference on Photoacoustic and Photothermal Phenomena
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A photo-activation tool of a small photo-response protein2022

    • Author(s)
      Masahide Terazima
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Optics and Photonics in Medicine and Biology Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Salt effect on diffusion signal reveals selective photoinduced dimerization site of a BLUF domain of EB12022

    • Author(s)
      Masahide Terazima, Kosei Shibata, Yusuke Nakasone
    • Organizer
      EMLG/JMLG 2022 conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Nonlinear Light Intensity Dependence of a Photosensor Protein Detected by Time-Resolved Diffusion Method2022

    • Author(s)
      Masahide Terazima, Kosei Shibata, Yusuke Nakasone
    • Organizer
      Frontiers in Optics and Laser Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Wavelength Selective Diffraction Grating Using Silver Nano Hemispherical Structure2022

    • Author(s)
      Tomoya Kubota, Yuya Nakatsuka, Soshi Endo, Tetsuya Matsuyama, Kenji Wada, Koichi Okamoto
    • Organizer
      International Conference on Nano-photonics and Nano-optoelectronics 2022 (ICNN2022)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 金属ナノ構造を用いたグレーティング構造の光学特性測定2022

    • Author(s)
      久保田 隼也,中塚 祐哉,時盛 将吾,松山 哲也,和田 健司,岡本 晃一
    • Organizer
      日本光学会年次学術講演会 Optics & Photonics Japan 2022 (OPJ2022)

URL: 

Published: 2023-12-25  

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