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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Structural biology studies on the effect of phospholipid contents for multi-drug transporters

Research Project

Project/Area Number 21K19333
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

加藤 博章  京都大学, 薬学研究科, 教授 (90204487)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2023-03-31
Keywords構造生物学 / 膜タンパク質 / リン脂質膜 / トランスポーター / 多剤耐性
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、脂質ナノディスクに挿入した多剤排出トランスポーターが同一化合物に対して異なる薬理学的な挙動を示したことの原因が、リン脂質組成の違いによることを詳細な立体構造解析と薬理学的機能解析によって明らかにするものである。この研究により、膜タンパク質の立体構造とその作用メカニズム対して脂質膜環境が果たしている役割が解明できるものと期待される。そこで、多剤排出トランスポーターのうち、ABCB1とABCG2のホモログとして2種類のATP Binding Cassette(ABC)タイプの多剤排出トランスポーターを様々な真核生物の細胞膜組成のリン脂質とともにナノディスクに再構成することができた。そして、それらのナノディスク中におけるATP加水分解活性を測定した。その結果、輸送基質存在下と非存在下における比活性の違いを詳しく計測することができた。そして、それらトランスポーターを埋め込んだナノディスクを用いて極低温電子顕微鏡を用いた単粒子(CryoEM)解析を行ったところ、高分解能での構造決定が可能な電顕像を測定することができたことから、その立体構造解析を行った。その結果、それぞれの分子の電子顕微鏡密度を得て、分子構造モデルを作成することに成功した。その結果、輸送基質を結合している状態を明らかにすることができた。また、リン脂質組成の違いに依存して、内向型状態と外向型状態の割合に違いが生じていることが推定された。さらに、ナノディスク状態と界面活性剤に可溶化した状態でのリガンド結合の違いを明らかにすることを目的として、ナノディスク状態でリガンド結合に伴うトリプトファン蛍光強度の消光を利用した実験系を構築した。その方法を用いて両状態におけるリガンド結合の違いを測定した。

  • Research Products

    (4 results)

All 2022

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Structure‐based alteration of tryptophan residues of the multidrug transporter <scp>CmABCB1</scp> to assess substrate binding using fluorescence spectroscopy2022

    • Author(s)
      Inoue Yoshiki、Yamaguchi Tomohiro、Otsuka Tetsuo、Utsunomiya Yuto、Pan Dongqing、Ogawa Haruo、Kato Hiroaki
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 31 Pages: e4331

    • DOI

      10.1002/pro.4331

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ABCトランスポーターのリン脂質膜中と界面活性剤中における薬物親和性の違い2022

    • Author(s)
      相良優介、水沼 諒、小川治夫、加藤博章
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
  • [Presentation] X線結晶解析によるABCトランスポーターの多剤認識メカニズム2022

    • Author(s)
      水沼 諒、小田島 圭、三和 空知、瀧川 紘、高須 清誠、小川 治夫、加藤 博章
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡によるABC多剤排出トランスポーターと基質複合体の単粒子構造解析2022

    • Author(s)
      坂口 俊平、水沼 諒、宮田 知子、牧野 文信、難波 啓一、小川 治夫、加藤 博章
    • Organizer
      第43回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム

URL: 

Published: 2023-12-25  

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