2022 Fiscal Year Annual Research Report
メタゲノムデータを基盤とした薬剤耐性菌に対する次世代ファージ療法の挑戦的開発
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21K19495
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
植松 智 東京大学, 医科学研究所, 特任教授 (50379088)
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2021-07-09 – 2023-03-31
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| Keywords | バクテリオファージ療法 / 次世代ファージ療法 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
我々は、スパコン上にファージゲノム解析パイプラインを構築した。さらに宿主細菌の染色体上のプロファージ配列を検索し、そこからファージ由来の抗菌酵素遺伝子を抽出する手法も開発した。エンドライシンはファージ由来酵素で、ペプチドグリカン層を破壊するためグラム陽性菌には極めて有効である。これまで偽膜性腸炎の原因菌であるClostridiodes defficileに対して新規の10種類のエンドライシンを同定している。Acinetobacter baumanniiは、グラム陰性菌で昨今多剤耐性化が社会問題となっている。我々はこのウイルスゲノム解析法とメタゲノムデータベースを利用して薬剤耐性のA. baumanniiに対する次世代ファージ療法を目指す。今年度は、国内で入手可能なA. baumannii 32菌株のショットガンシークエンスデータからコンティグを作成し、データベース（RefSeqなど）を用いてアミノ酸配列を検索した。さらに、ORFから酵素名をテキスト検索し、それぞれについて３次構造の確認までを行った。A. baumanniiにはグラム陰性菌であり、ペプチドグリカン層はLPSをまとった外膜の内側に存在する。そのため、外部からのエンドライシンでは溶菌効果は認められない。A. baumanniiの溶菌に効果的と思われるLPSを溶解する酵素としてdepolymerase群を検索対象とした。計５種類の新規depolymeraseを同定することができた。現在たんぱく合成を進めin vitroでの溶菌効果を検証している。さらに国立感染症研究所が公開しているJARBBパネルに登録されているA. baumanniiのゲノム情報をダウンロードし、追加の検索も進行している。A. baumannii特異的なLPS溶菌酵素候補を複数同定出来たことは大きな成果である。
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[Journal Article] Bronchoalveolar lavage fluid reveals factors contributing to the efficacy of PD-1 blockade in lung cancer.2022
Author(s)
Masuhiro K, Tamiya M, Fujimoto K, Koyama S, Naito Y, Osa A, Hirai T, Suzuki H, Okamoto N, Shiroyama T, Nishino K, Adachi Y, Nii T, Kinugasa-Katayama Y, Kajihara A, Morita T, Imoto S, Uematsu S, Irie T, Okuzaki D, Aoshi T, Takeda Y, Kumagai T, Hirashima T, Kumanogoh A.
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Journal Title
JCI Insight.
Volume: 7(9)
Pages: e157915
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The microsomal prostaglandin E synthase-1/PGE2 axis induces recovery from ischemia via recruitment of regulatory T cells.2022
Author(s)
Amano H, Eshima K, Ito Y, Nakamura M, Kitasato H, Ogawa F, Hosono K, Iwabuchi K, Uematsu S, Akira S, Narumiya S, Majima M.
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Journal Title
Cardiovasc Res.
Volume: cvac137
Pages: 1-16
DOI
Peer Reviewed
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