The significance of non-self-variant pregnancy outcomes based on mother-child pair genome sequence information

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K19551
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 56:Surgery related to the biological and sensory functions and related fields
• Research Institution: Chiba University
• Principal Investigator: Usui Hirokazu 千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (90375634)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 中田 恵美里 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (30447289) ; 羽生 裕二 千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (40816162) ; 佐藤 明日香 千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (60779859)
• Project Period (FY): 2021-07-09 – 2023-03-31
• Keywords: 妊娠 / 胎盤 / 非自己バリアント / 三世代コホート / 東北メディカル・メガバンク

Outline of Final Research Achievements

The whole genome sequences data of Tohoku Medical Megabank Project Birth and Three-Generation Cohort Study (TMM BirThree Cohort Study) were analyzed. Non-self variants recognizable by the mother were extracted for each parental-child pair. The number of non-self variants per parental-child pair was less than or equal to 100. There was no apparent difference in placenta-specific synonymous variants between the group with gestational hypertension and the group without gestational hypertension. In order to verify the significance of non-self variants, it was deemed necessary to verify whether the mother actually recognizes non-self.

Free Research Field

産婦人科

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

母が自らとは異なる配列を有する非自己バリアント蛋白が胎盤に存在する可能性がゲノム塩基配列レベルで推定された。妊娠アウトカムに対する評価を行うには、評価する症例ペアを増やし、胎盤での両アレル性の発現、非自己バリアント蛋白質の立体構造予測、非自己バリアント蛋白質対する抗体を母が有しているかなどの検討が必要であると考えられる。