2022 Fiscal Year Research-status Report
Relations between cell population dynamics in non-stationary environment and generation time fluctuation
| Project/Area Number |
21K20672
|
|---|
| Research Institution | The University of Tokyo |
|---|
Principal Investigator |
野添 嵩 東京大学, 大学院総合文化研究科, 助教 (30910533)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2021-08-30 – 2024-03-31
|
| Keywords | 1細胞計測 / 細胞系譜 / 表現型ゆらぎ / 個体群動態 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
前年度に引き続き有限集団の定常データに適用可能な既存の手法の妥当性及び限界を確認するための数値シミュレーションと実験データにへの適用を行ったことに加え、本年度は定常性の低い既存の実験データの解析を行った。
まず従来の細胞系譜解析手法が環境の定常性を前提とせず適用できることに着目し、集団として増殖が静止した状態から採取された細胞が指数関数的に増殖するようになる過程という定常性の低い細胞系譜を定常性の高い細胞系譜と比較した。新たに導入された2種類の選択強度は、定常性の高い環境ではほぼ同じ値をとる傾向を示す一方で、定常性の低い細胞系譜ではその傾向から大きく外れることがわかった。以上の成果は本年度出版された論文で報告している。さらに、この論文では世代時間がゆらぐ増殖モデルでの理論計算も行っており、この結果も本研究を進める上で重要な指針となる。
次に細胞の排除や死亡を含む個体群動態において細胞の定量的形質の違いによる選択がどの程度起きるのかを定量的に評価する方法を考案した。この手法は細胞の排除や死亡が起こらない細胞系譜を対象とした従来の解析の枠組みの拡張となっている。成長を持続する細菌集団に対し致死濃度の抗生物質を投与する中での生き死にを追跡した細胞系譜を対象とした解析や、増えた細胞を排除しながら一定数の細胞集団を維持するような増殖系の実験データを対象にした解析を行い、本手法の実験データへ適用可能性を評価した（海外共同研究者との共著論文として投稿中）。
以上の成果は次年度実施する予定の変動環境下における増殖する細胞集団の実験データを解析する上で有用であることが期待される。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
本年度は共同研究の機会を得て細胞の排除や死亡を含む細胞系譜の解析手法について大きな進展が見られた一方で今年度の目標であった環境変動実験の実施に至らなかったため。
|
| Strategy for Future Research Activity |
変動環境下の有限集団の長期計測実験を実施する。
これまで進めてきた非定常環境下の集団動態に関する理論的な知見について整理し公開することを目指す。
|
| Causes of Carryover |
研究の打ち合わせのための海外出張が実施できなかったため旅費計上分が未使用であったこと、および目標としていた論文出版が年度内に間に合わなかったことが、次年度への繰越となった主要な理由である。次年度は長期計測実験の実施に必要な消耗品のほか、研究成果発表や研究打ち合わせのための国内外出張費および論文出版費用として使用する予定である。
|
Research Products
(5 results)
