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2014 Fiscal Year Annual Research Report

植物の生存戦略としての細胞内膜系の分化機構の解明

Research Project

Project/Area Number 22000014
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

西村 いくこ  京都大学, 理学研究科, 教授 (00241232)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 嶋田 知生  京都大学, 理学研究科, 講師 (20281587)
田村 謙太郎  京都大学, 理学研究科, 助教 (40378609)
Project Period (FY) 2010-04-21 – 2015-03-31
Keywordsシロイヌナズナ / 細胞内膜系動態 / 小胞体 / 細胞骨格 / 環境応答 / 環境ストレス / 生体防御 / 植物免疫
Outline of Annual Research Achievements

免疫細胞を持たない植物は, 全身の細胞が外敵や環境ストレスから個体を守るための仕組みをもつ必要がある. 本研究の目的は, 小胞輸送系を含む細胞内膜系の動態という視点から, 植物の感染防御応答や環境ストレス応答を解析し, 細胞から個体レベルでの「植物の生存戦略」の理解を目指すことである. 当該年度の具体的な成果は下記の通りである.
(1) 病害虫応答制御系では, 地上部での食植生昆虫からの防御系を担うミロシン細胞が, 葉の維管束に沿って配備されることを証明した. 植物のライフラインというべき組織を重点的に防御する戦略と位置づけられる. 予想外の成果としては, ミロシン細胞の分化が, 表皮組織の気孔(孔辺細胞)の分化マスター遺伝子として知られているFAMAによって制御されていることが分かった. 両細胞は, 形態も機能も分布域も全く異なるにも関わらず, 葉の原基からの分化の段階で共通の経路を辿ることは興味深い現象と言える.
(2) これまで細胞内膜系の動態の駆動力となっているミオシンモーターに注目して研究を推進し, 小胞体流動や細胞核の運動の分子機構を明らかにしてきた. シロイヌナズナのMyosin XI classには13メンバーが存在する. これらのメンバーの多重欠損変異体の表現型の解析から, 今年度は, 植物の基本的な成長原理に迫る発見があった. Myosin XIが欠損すると植物体は真直ぐに成長できない. また, Myosin XI欠損変異体の様々な器官は光や重力等の刺激に対して過剰に応答することが分かった. 植物が光や重力等の環境刺激に応答して屈性反応を起こすことは良く知られている. この屈性は器官の屈曲を伴うが, Myosin XIはこの屈曲のブレーキとして働いていることが分かった. 本成果はNature Plants誌の2015年4月号の表紙を飾るとともにウエブサイトのトップページで「Reach for the sky」のタイトルで紹介された.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当該年度は本特別推進研究の最終年度にあたり, 細胞内膜系のorganizationとdynamicsそのものを支えている分子機構の解明を目指してきたが, これを基盤とする植物の細胞応答について当初の目的はほぼ達成できたと考える. また, 上記の通り, 予想外の成果も得ることができた. 特に, 病害虫応答制御系では, 周囲の細胞とは異なる特殊な細胞(異型細胞)を作り出す機構の存在を示すことができ, 環境応答系としては, 「植物の器官が真直ぐに伸びる」という概念(Straightening)に迫る「Actin-Myosin XI依存的なStraightening機構」の発見ができた. 器官屈曲の感知(深部感覚)にも繋がり, 植物の器官の屈性応答研究にブレークスルーを与えることができたと考える.

Strategy for Future Research Activity

本特別推進研究により, 「11. 現在までの達成度」に記載の通り, 植物の成長原理に迫る課題が浮上してきた. 特別推進研究としては, 現在取得している未発表データについて, 残された研究を実施し成果を確実なものとして論文発表する. 一方, 将来的には, これらの課題の解明に向けて新たな研究を展開する.

  • Research Products

    (37 results)

All 2015 2014

All Journal Article (17 results) (of which Peer Reviewed: 16 results) Presentation (20 results) (of which Invited: 7 results)

  • [Journal Article] 植物の細胞核を駆動するミオシンXI-i複合体~細胞内で核を動かすしくみは動物と植物で異なっていた~2015

    • Author(s)
      田村謙太郎, 西村いくこ
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 53 Pages: 69-70

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2015.870034

  • [Journal Article] Oil body-mediated defense against fungi : From tissues to ecology2015

    • Author(s)
      Shimada TL, Takano Y, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      Plant Signal Behav

      Volume: 10 Pages: e989036

    • DOI

      10.4161/15592324.2014.989036

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recent advances in understanding plant nuclear envelope proteins involved in nuclear morphology2015

    • Author(s)
      Tamura K, Goto C, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      J Exp Bot

      Volume: 66 Pages: 1641-1647

    • DOI

      10.1093/jxb/erv036

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] BEACH-Domain Proteins Act Together in a Cascade to Mediate Vacuolar Protein Trafficking and Disease Resistance in Arabidopsis.2015

    • Author(s)
      Teh OK, Hatsugai N, Tamura K, Fuji K, Tabata R, Yamaguchi K, Shingenobu S, Yamada M, Hasebe M, Sawa S, Shimada T, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      Mol Plant

      Volume: 8 Pages: 389-398

    • DOI

      10.1016/j.molp.2014.11.015

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A direction-selective local-thresholding method, DSLT, in combination with a dye-based method for automated three-dimensional segmentation of cells and airspaces in developing leaves2015

    • Author(s)
      Kawase T, Sugano SS, Shimada T, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      Plant J

      Volume: 81 Pages: 357-366

    • DOI

      10.1111/tpj.12738

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An ABC transporter B family protein, ABCB19, is required for cytoplasmic streaming and gravitropism of the inflorescence stems2015

    • Author(s)
      Okamoto, K., Ueda, H., Shimada, T., Tamura, K., Koumoto, Y., Tasaka, M., Morita, M.T., and Hara-Nishimura, I.
    • Journal Title

      Plant Signal Behav

      Pages: KPSB 1010947

    • Description
      【掲載確定】
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Vacuolar processing enzyme in plant programmed cell death2015

    • Author(s)
      Noriyuki Hatsugai, Kenji Yamada, Shino Goto-Yamada and Ikuko Hara-Nishimura
    • Journal Title

      Front Plant Sci

      Volume: 6 Pages: 1-11

    • DOI

      10.3389/fpls.2015.00234

    • Description
      【掲載確定】
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of organ straightening and plant posture by an actin-myosin XI cytoskeleton2015

    • Author(s)
      Okamoto, K., Ueda, H., Shimada, T., Tamura, K., Kato, T., Tasaka, M., Morita, M.T., and Hara-Nishimura, I.
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 1 Pages: 1-6

    • DOI

      10.1038/NPLANTS.2015.31

    • Description
      【掲載確定】
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The mitochondrial Ras-related GTPase Miro : views from inside and outside the metazoan kingdom2015

    • Author(s)
      Yamaoka, S., Hara-Nishimura, I.
    • Journal Title

      Front. Plant Sci

    • DOI

      310.3389/fpls.2014.00350

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CONTINUOUS VASCULAR RING (COV1) is a trans-Golgi Network-Localized Membrane Protein Required for Golgi Morphology and Vacuolar Protein Sorting2014

    • Author(s)
      Shirakawa M, Ueda H, Koumoto Y, Fuji K, Nishiyama C, Kohchi T, Hara-Nishimura I, Shimada T.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol

      Volume: 55 Pages: 764-772

    • DOI

      10.1104/pp.113.230185

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Novel Nuclear Envelope Protein KAKU4 Modulates Nuclear Morphology in Arabidopsis2014

    • Author(s)
      Goto C, Tamura K, Fukao Y, Shimada T, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      Plant Cell

      Volume: 26 Pages: 2143-2155

    • DOI

      10.1105/tpc.113.122168

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional insights of nucleocytoplasmic transport in plants2014

    • Author(s)
      Tamura K, Hara-Nishimura I
    • Journal Title

      Front Plant Sci

      Volume: 5 Pages: 1-10

    • DOI

      10.3389/fpls.2014.00118

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] GFS9/TT9 contributes to intracellular membrane trafficking and flavonoid accumulation in Arabidopsis thaliana2014

    • Author(s)
      Ichino T, Fuji K, Ueda H, Takahashi H, Koumoto Y, Takagi J, Tamura K, Sasaki R, Aoki K, Shimada T, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      Plant J

      Volume: 80 Pages: 410-423

    • DOI

      10.1111/tpj.12637

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of defective endosomal trafficking to the vacuole by monitoring seed storage proteins in Arabidopsis thaliana2014

    • Author(s)
      Shimada T, Koumoto Y, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol

      Volume: 1209 Pages: 131-142

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-1420-3_10

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FAMA Is an Essential Component for the Differentiation of Two Distinct Cell Types, Myrosin Cells and Guard Cells, in Arabidopsis2014

    • Author(s)
      Shirakawa M, Ueda H, Nagano AJ, Shimada T, Kohchi T, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      Plant Cell

      Volume: 26 Pages: 4039-4052

    • DOI

      10.1105/tpc.114.129874

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Myrosin cell development is regulated by endocytosis machinery and PINl polarity in leaf primordia of Arabidopsis thaliana2014

    • Author(s)
      Shirakawa M, Ueda H, Shimada T, Kohchi T, Hara-Nishimura I.
    • Journal Title

      Plant Cell

      Volume: 26 Pages: 4448-4461

    • DOI

      10.1105/tpc.114.131441

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microtubules Contribute to Tubule Elongation and Anchoring of Endoplasmic Reticulum, Resulting in High Network Complexity in Arabidopsis thaliana2014

    • Author(s)
      Hamada, T., Ueda, H., Kawase, T., and Hara-Nishimura, I.
    • Journal Title

      Plant Physiol

      Volume: 166 Pages: 1869-1876

    • DOI

      10.1104/pp.114.252320

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 植物の核膜がもつ新しい役割2015

    • Author(s)
      田村謙太郎, 岩渕功誠, 深尾陽一2, 近藤真紀, 岡本圭史, 上田晴子, 西村幹夫, 西村いくこ
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山市)
    • Year and Date
      2015-03-18 – 2015-03-20
    • Invited
  • [Presentation] 方向選択的局所二値化法(DSLT)と反復セグメンテーションアルゴリズム2015

    • Author(s)
      川瀬貴士、菅野茂夫、嶋田知生、西村いくこ
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都)
    • Year and Date
      2015-03-18
  • [Presentation] 小胞体-ゴルジ体間のタンパク質輸送に関わるMAG3の機能解析2015

    • Author(s)
      高木純平, 嶋田知生, 高橋英之, 長野稔, 藤原正幸, 深尾陽一朗, 上田晴子, 田村謙太郎, 嶋田知生, 西村いくこ
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都)
    • Year and Date
      2015-03-16
  • [Presentation] ECHIDNAはタンパク質の液胞輸送と液胞の形態に関与する2015

    • Author(s)
      市野琢爾、嶋田知生、西村いくこ
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都)
    • Year and Date
      2015-03-16
  • [Presentation] 気孔形成における非対称分裂に影響を与える低分子化合物の解析2015

    • Author(s)
      阪井裕美子, 菅野茂夫, 嶋田知生, 西村いくこ
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都)
    • Year and Date
      2015-03-16
  • [Presentation] シロイヌナズナAP-2複合体の生理機能の解明2015

    • Author(s)
      門脇千穂, 髙木純平, 白川一, 川瀬貴士, 榊原均, 小嶋美紀子, 山岡尚平, 上田晴子, 田村謙太郎, 嶋田知生, 西村いくこ
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都)
    • Year and Date
      2015-03-16
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける小胞体に異常を示す変異体の解析2015

    • Author(s)
      太田奈津美, 上田晴子, 濱田隆宏, 木森義隆, 嶋田知生, 山田健志, 田村謙太郎, 近藤真紀, 亀井保博, 西村幹夫, 西村いくこ
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都)
    • Year and Date
      2015-03-16
  • [Presentation] The distinct roles of Arabidopsis AP complexes in plant post-Golgi trafficking2015

    • Author(s)
      Shimada T., Shimono Y., Shirakawa M., Teh O., Yamaoka S., Fuji K., Fukao Y., Tamura Kl, and Hara-Nishimura I.
    • Organizer
      2nd International Symposium on Plant Environmental Sensing
    • Place of Presentation
      産業技術総合研究所(東京都)
    • Year and Date
      2015-03-14
  • [Presentation] 植物の細胞内膜系が支える生体防御戦略2014

    • Author(s)
      西村いくこ
    • Organizer
      The 37th Annual Meeting of MBSJ
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2014-11-27
    • Invited
  • [Presentation] Endomembrane-mediated plant defense strategies against pathogens and herbivore2014

    • Author(s)
      I. Hara-Nishimura
    • Organizer
      The 38th Naito Conference on Molecule-based Biological Systems
    • Place of Presentation
      札幌市
    • Year and Date
      2014-10-09
    • Invited
  • [Presentation] Endomembrane dynamics and its role of plant defense2014

    • Author(s)
      I. Hara-Nishimura
    • Organizer
      Bristol-Kyoto Symposium (Pleanary lecture)
    • Place of Presentation
      Bristol, UK
    • Year and Date
      2014-09-23
    • Invited
  • [Presentation] Identification of a chemical compound that affects the stomatal one-cell-spacing rule in Arabidopsis thaliana2014

    • Author(s)
      Yumiko Sakail, Shigeo S. Sugano2, Takashi Kawasel, Makoto Shirakawal, Tomoo Shimadal and Ikuko Hara-Nishimural
    • Organizer
      Bristol-Kyoto Symposium
    • Place of Presentation
      Bristol, UK
    • Year and Date
      2014-09-23
  • [Presentation] 植物の細胞内ダイナミクス2014

    • Author(s)
      上田晴1, 横田悦雄, 朽名夏麿, 西村いくこ
    • Organizer
      バイオイメージング学会公開講座
    • Place of Presentation
      大阪大学吹田キャンパス(吹田市)
    • Year and Date
      2014-09-06
    • Invited
  • [Presentation] Interactive proteomics dissects structural dynamics of plant nuclear envelope2014

    • Author(s)
      Tamura Kl, Fukao Y., and Hara-Nishimura I.
    • Organizer
      International Plant Proteomics Organisation 2014
    • Place of Presentation
      Hamburg (Germany)
    • Year and Date
      2014-09-01
    • Invited
  • [Presentation] trols the formation of COPII vesicles at endoplasmic reticulum exit sites in Arabil2014

    • Author(s)
      Takagi J., Renna 2, Takahashi Hl, Koumoto Y., Tamura K., Stefano G., Fukao Y., Kondo M., Nishimura M., Shimada T., Brandizzi F., Hara-Nishimura I.
    • Organizer
      Plant Biology 2014
    • Place of Presentation
      Portland (United States)
    • Year and Date
      2014-07-13 – 2014-07-15
  • [Presentation] Myosin XI-i is required for nuclear movement and shape in Arabidopsis2014

    • Author(s)
      Tamura K., Iwabuchi K., Fukao, Y2, Kondo M3, Okamoto K., Ueda, H., Nishimura, M. and Hara-Nishimura, I.
    • Organizer
      East Asian Cell Biology Conference 2014
    • Place of Presentation
      Pohang (Korea)
    • Year and Date
      2014-04-04
  • [Presentation] MAG5 functions in COPII vesicle formation at ER exit sites in Arabidopsis2014

    • Author(s)
      Takagi J, Shimada, T. and Hara-Nishimura, I.
    • Organizer
      East Asian Cell Biology Conference 2014
    • Place of Presentation
      Pohang (Korea)
    • Year and Date
      2014-04-04
  • [Presentation] GFS9-dependent membrane trafficking contributes to flavonoid accumulation2014

    • Author(s)
      Ichino T., (Fuji K., Ueda H., Takahashi H., Koumoto Y., Tamura K., Sasaki R., Aoki K., Shimada Tl and Hara-Nishimura I.
    • Organizer
      East Asian Cell Biology Conference 2014
    • Place of Presentation
      Pohang (Korea)
    • Year and Date
      2014-04-04
  • [Presentation] 植物細胞に魅せられて2014

    • Author(s)
      西村いくこ
    • Organizer
      基礎生物学研究所研究会 生物学のすすめ
    • Place of Presentation
      基礎生物学研究所
    • Year and Date
      2014-03-28
    • Invited
  • [Presentation] Endomembrane-mediated plant defense systems2014

    • Author(s)
      I. Hara-Nishimura
    • Organizer
      KYOTO PLANT SCIENCES SYMPOSIUM
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2014-01-10

URL: 

Published: 2016-06-01  

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